multtest公司
基于重采样的多假设检验
生物导体版本:释放(3.19)
基于非参数自举和置换重采样的多重测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制家族错误率(FWER)、广义家族错误率、假阳性比例的尾部概率(TPPFP)和假发现率(FDR)。实现了几种基于引导的空分布选择(居中、居中和缩放、分位数转换)。可采用单步法和分步法。包括基于各种t-和F-统计量的测试(包括基于线性和生存模型回归参数的t-统计量,以及基于相关参数的t-统计量)。当使用t-统计量探测假设时,用户还可以选择一个可能更快的零分布,该零分布是多元正态分布,均值为零,方差协方差矩阵由向量影响函数导出。结果根据调整后的p值、置信区间和检验统计截止值进行报告。该程序直接适用于在DNA微阵列实验中识别差异表达基因。
作者:凯瑟琳·波拉德(Katherine S.Pollard)、休斯顿·N·吉尔伯特(Houston N.Gilbert)、葛永超(Yongchao Ge)、桑德拉·泰勒(Sandra Taylor)、桑德琳·杜多特(Sandrine Dudoit)
维护人员:凯瑟琳·波拉德(Katherine S.Pollard)
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“multtest”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
细节
生物视图 |
差异表达式,微阵列,多重比较,软件 |
版本 |
2.60.0个 |
在生物导体中 |
BioC 1.6(R-2.1)或更早(>19年) |
许可证 |
LGPL公司 |
取决于 |
R(>=2.10),方法,生物遗传学,博科生物 |
进口 |
生存,MASS,统计4 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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雪 |
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取决于我 |
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程序包档案
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