突触

用于最佳识别和定量的无标签数据分析管道

生物导体版本：释放（3.18）

突触包提供了重新分析Synapt G2质谱仪上获得的无标签蛋白质组数据的功能。可以将一次或多次运行（可能通过额外的离子迁移率分离来提高识别准确度）与其他定量文件相结合，以最大限度地提高识别和定量准确度。

作者：劳伦·加托（Laurent Gatto）、尼克·邦德（Nick J.Bond）、帕维尔·V·夏利亚（Pavel V.Shliaha）和塞巴斯蒂安·吉布（Sebastian Gibb）。

维护人员：Laurent Gatto<加州大学洛杉矶分校Laurent.Gatto>Sebastian Gibb<sebastiangibb.de>

引文（从R中输入引文（“synapter”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：install（“synapter”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“突触”）

使用“synapter”组合HDMSe/MSe数据以优化识别和定量	HTML格式	R脚本
使用“synapter”进行片段匹配	HTML格式	R脚本
突触体2和协同作用2	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式

生物视图	免疫肿瘤学,质谱学,蛋白质组学,质量控制,软件
版本	2.26.0
在生物导体中	生物技术2.11（R-2.15）（11.5年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=3.1.0），方法，M数据库(>= 2.1.2)
进口	R彩色啤酒，格子，q值,multtest公司，实用程序，工具，博科生物,生物串,切割器（>=1.3.3），读数（>=0.2），rmarkdown（>=1.0）
系统要求
统一资源定位地址	https://lgatto.github.io/synapter网站/

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包	突触2.26.0.tar.gz
Windows二进制	synapter_2.26.0.zip
macOS二进制（x86_64）	突触2.26.0.tgz
macOS二进制（arm64）	突触2.26.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synapter网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/突触
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/synapter网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/synapter网站/
软件包下载报告	下载统计信息