motif测试R
对序列数据中的结合基序进行关键测试
生物导体版本：释放（3.19）
将一组序列基序作为PWM，测试一组序列是否过度表示这些基序，以及基序集中的任何位置特征。可以使用多种统计方法进行富集分析。该包还包含核心功能，用于为分析准备数据，并将结果可视化。
作者：史蒂夫·佩德森（Stevie Pederson）[aut，cre]
维护人员：史蒂夫·佩德森（Stevie Pederson）<stephen.Pederson.au at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“motifTestR”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“motifTestR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“motifTestR”）
细节
| 生物视图 |
ChIPSeq公司,芯片芯片,Motif注释,序列匹配,软件 |
| 版本 |
1.0.3 |
| 在生物导体中 |
生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
生物串,基因组范围,ggplot2（>=3.5.0），R（>=4.3.0） |
| 进口 |
基因组信息Db,谐波平均值,I范围,矩阵统计，方法，并行，拼凑,爱尔兰航空公司,S4载体，统计，普世运动 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/smped/motifTestR网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/smped/motifTestR/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
