普世运动

使用R导入、修改和导出Motif

生物导体版本：释放（3.18）

允许将最常见的图案类型导入到R中，以供其他生物导体图案相关软件包提供的功能使用。motif可以从其他Bioconductor包定义的各种类别导出为大多数主要的motif格式。包括一套基序和序列操作和分析功能，包括丰富、比较、P值计算、洗牌、修剪、高阶基序等。

作者：本杰明·詹·马利·特伦布雷[aut，cre]，斯宾塞·尼斯特罗姆

维护人员：本杰明·詹·马里·特伦布雷（Benjamin Jean-Marie Tremblay）

引文（从R中输入引文（“universalmotif”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“universalmotif”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“universalmotif”）

生物视图	数据导入,基因调控,Motif注释,MotifDiscovery公司,软件
版本	1.20.0
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（5.5年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=3.5.0）
进口	方法、stats、utils、MASS、ggplot2、yaml、，I范围，卢比，生物串,生物遗传学,S4载体，rlang，网格，矩阵泛型
系统要求
统一资源定位地址	https://bioconductor.org/packages/universalmotif网站/
错误报告	https://github.com/bjmt/universalmotif/issues

建议	拼写、编织、书籍，TFBS工具，rmarkdown，MotifDb公司，测试，生物并行,seq徽标,motif堆栈，dplyr，猿，ggtree（ggtree）、processx、ggseqlogo、cowplot、，基因组范围,ggbio公司
链接到	Rcpp、Rcpp线程
增强功能	PWMEnrich公司,rGADEM公司
取决于我
导入我	循环RNA分析器,模因
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	通用消息_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	通用motif_1.20.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	通用消息_1.20.0.tgz
macOS二进制（arm64）	通用消息_1.20.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/universalmotif
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/universalmotif
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/universalmotif/
程序包短Url	https://bioductor.org/packages/universalmotif（https://bioductor.org/packages/universalmotif）/
软件包下载报告	下载统计信息