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亚硫酸氢钠全基因组测序中差异甲基化区域的检测与推断
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包实现了一种扫描基因组的方法，以便从全基因组亚硫酸氢盐测序数据中检测差异甲基化区域并对其进行准确推断。该方法基于将检测到的区域与合并的空分布进行比较，即使每个总体只有两个样本可用，也可以实现该方法。通过使用嵌套自回归相关误差结构拟合广义最小二乘（GLS）回归模型，获得区域级统计数据，以了解兴趣对转化甲基化比例的影响。
作者：基根·科特豪尔[cre，aut]
，拉斐尔·伊里扎里[aut]，尤瓦尔·本雅米尼〔aut〕，苏蒂尔塔·查克拉博蒂〔aut〕
维护人员：基根·科尔特豪尔（Keegan Korthauer）<基根在stat.ubc.ca>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“dmrseq”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“dmrseq”）
细节
| 生物视图 |
脱氧核糖核酸甲基化,差异甲基化,表观遗传学,功能基因组学,免疫肿瘤学,多重比较,回归,排序,软件,全基因组 |
| 版本 |
1.24.1 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.7（R-3.5）（6.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=3.5），bsseq公司 |
| 进口 |
基因组范围,国家实验室,ggplot2,S4载体,R彩色啤酒,颠簸猎人,延迟矩阵统计(>= 1.1.13),矩阵统计,生物并行,离群值、方法、，位置匹配,I范围，grDevices，图形，统计数据，实用程序，注释器,批注中心,无线电跟踪器,基因组信息Db，花键 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
