差异（diffcyt）

高分辨率聚类在高维细胞术中的差异发现

生物导体版本：释放（3.19）

基于高分辨率聚类和改编自转录组学的经验贝叶斯调节测试的组合，在高维细胞术数据（包括流式细胞术、质谱细胞术或CyTOF和寡核苷酸标记的细胞术）中进行差异发现分析的统计方法。

作者：卢卡斯·韦伯[aut，cre]

维护人员：卢卡斯·韦伯（Lukas M.Weber）<lmweberedu at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“diffcyt”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“diffcyt”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“diffcyt”）

生物视图	基于细胞的分析,细胞生物学,群集,特征提取,流式细胞术,免疫肿瘤学,蛋白质组学,单个单元格,软件
版本	1.24.0
在生物导体中	生物技术3.7（R-3.5）（6年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.4.0）
进口	flowCore（流动堆芯）,FlowSOM公司,总结性实验,S4载体,利马,边缘R,lme4公司,多路放大器,数字播放器,第三年,重塑2,马格里特、stats、methods、utils、grDevices、graphics、，复杂热图,绕圈子，网格
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/lmweber/diffcyt网址
错误报告	https://github.com/lmweber/diffcyt/issues

建议	仿生风格,针织物,rmarkdown公司,测试,HD细胞数据,催化剂
链接到
增强功能
取决于我	审查,cytof工作流
导入我	CyTOF功率,树冠R,treekoR树
建议我	催化剂
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	差异_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	差异_1.24.0.zip
macOS二进制（x86_64）	差异_1.24.0.tgz
macOS二进制（arm64）	差异_1.24.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffcyt
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/diffcyt
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/diffcyt网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/diffcyt/
软件包下载报告	下载统计信息