flowCore(流动堆芯)
flowCore:流式细胞术数据的基本结构
生物导体版本:释放(3.18)
提供S4数据结构和处理流式细胞仪数据的基本功能。
作者:B Ellis[aut]、Perry Haaland[aut'、Florian Hahne[aut]、Nolwenn Le Meur[aut】、Nishant Gopalakrishnan[aut)、Josef Spidlen[au]、Mike Jiang[aut,cre]、Greg Finak[aut]、Samuel Granjeaud[ctb]
维护人员:Mike Jiang<来自ozette.com的Mike>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“flowCore”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“flowCore”)
细节
生物视图 |
基于细胞的分析,流式细胞术,免疫肿瘤学,基础设施,软件 |
版本 |
2.14.2 |
在生物导体中 |
BioC 2.0(R-2.5)(17年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=3.5.0) |
进口 |
博科生物,生物遗传学(>=0.29.2)、grDevices、graphics、methods、stats、utils、stats4、Rcpp、matrixStats、,细胞库(>= 2.13.1),S4载体 |
系统要求 |
GNU品牌,C++11 |
统一资源定位地址 |
|
查看更多
建议 |
Rgraphviz公司,流Viz,流量统计信息(>=3.43.4),测试,流工作区,流工作空间数据,开放细胞、knitr、,ggcyto细胞,网格额外 |
链接到 |
cpp11,BH(>=1.81.0.0),细胞库,RProtoBufLib数据库 |
增强功能 |
|
取决于我 |
流珠,流动箱,flowClean(流动清洗),流量切割,流量FP,flowMatch(流匹配),flowTime(流动时间),流量变送器,流Viz,流量VS,ggcyto细胞,HD细胞数据,健康流量数据,高吞吐量,免疫俱乐部,无限流量,ncdfFlow公司 |
导入我 |
催化剂,cmapR公司,自信,氰基过滤器,锡达尔,细胞Dx,细胞fQC,细胞MEM,细胞ML,细胞管道,细胞管道GUI,ddPCR集群,差异(diffcyt),流动AI,流珠,流CHIC,flowClust(流动俱乐部),流量密度,flowGate(流动闸门),flowMeans(流动平均值),流合并,流动倍体,FlowSOM公司,flowSpecs(流量规格),流量统计信息,流量变送器,流Viz,流工作区,网关查找器,免疫间隔,MetaCyto公司,ncdfFlow(ncdf流量),oneSENSE公司,开放细胞,和平QC,scDataviz公司,剪刀,斯科尼菲 |
建议我 |
COMPASS(指南针),flowPloidy数据 |
指向我的链接 |
|
生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。