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derfinder图

derfinder的绘图功能


生物导体版本:释放(3.19)

这个包为derfinder包中的结果提供了绘图功能。这有助于将绘制这些图所需的图形依赖项与derfinder的核心功能分离开来。

作者:莱昂纳多·科拉多·托雷斯,安德鲁·贾菲[aut],Jeffrey T.Leek[aut,ths]

维护人员:莱昂纳多·科拉多·托雷斯<lcoladotor at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“derfinderPlot”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“derfinderPlot”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“derfinderPlot”)
derfinderPlot简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 差异表达式,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,软件,可视化
版本 1.38.0
在生物导体中 生物技术3.0(R-3.1)(9.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.2)
进口 测深仪(>= 1.1.0),基因组信息Db(>= 1.3.3),基因组特征,基因组范围(>= 1.17.40),ggbio公司(>= 1.13.13),ggplot2、图形、grDevices、,I范围(>= 1.99.28),利马、方法、,普利尔,R彩色啤酒,重塑2,S4载体(>= 0.9.38),规模,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/leekgroup/derfinder绘图
错误报告 https://support.bioconductor.org/t/derfinder绘图
查看更多
建议 biovizBase公司(>= 1.27.2),颠簸猎人(>= 1.7.6),derfinder数据(>=0.99.0),sessioninfo(会话信息),针织物(>= 1.6),仿生风格(>=22.5.19),组织健康状况数据库,参考管理器,rmarkdown公司(>= 0.3.3),测试,TxDb(发送日期)。Hsapiens。UCSC.hg19.known基因,覆盖(covr)
链接到
增强功能
取决于我
导入我 重新计票工作流
建议我 测深仪,区域报告,基因组状态
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 derfinder绘图_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 derfinderPlot_1.38.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) derfinder绘图_1.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) derfinder绘图_1.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderPlot网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/derfinderPlot
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/derfinder绘图/
包短Url https://bioductor.org/packages/derfinderPlot(https://bioductor.org/packages/derfinderPlot)/
软件包下载报告 下载统计信息