derfinder图
derfinder的绘图功能
生物导体版本:释放(3.19)
这个包为derfinder包中的结果提供了绘图功能。这有助于将绘制这些图所需的图形依赖项与derfinder的核心功能分离开来。
作者:莱昂纳多·科拉多·托雷斯,安德鲁·贾菲[aut],Jeffrey T.Leek[aut,ths]
维护人员:莱昂纳多·科拉多·托雷斯<lcoladotor at gmail.com>
引文(从R中输入引文(“derfinderPlot”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“derfinderPlot”)
对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“derfinderPlot”)
细节
生物视图 |
差异表达式,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,软件,可视化 |
版本 |
1.38.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.0(R-3.1)(9.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=3.2) |
进口 |
测深仪(>= 1.1.0),基因组信息Db(>= 1.3.3),基因组特征,基因组范围(>= 1.17.40),ggbio公司(>= 1.13.13),ggplot2、图形、grDevices、,I范围(>= 1.99.28),利马、方法、,普利尔,R彩色啤酒,重塑2,S4载体(>= 0.9.38),规模,实用程序 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/leekgroup/derfinder绘图 |
错误报告 |
https://support.bioconductor.org/t/derfinder绘图 |
查看更多
建议 |
biovizBase公司(>= 1.27.2),颠簸猎人(>= 1.7.6),derfinder数据(>=0.99.0),sessioninfo(会话信息),针织物(>= 1.6),仿生风格(>=22.5.19),组织健康状况数据库,参考管理器,rmarkdown公司(>= 0.3.3),测试,TxDb(发送日期)。Hsapiens。UCSC.hg19.known基因,覆盖(covr) |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
重新计票工作流 |
建议我 |
测深仪,区域报告,基因组状态 |
指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。