crispr蝴蝶结

基于Bowtie的CRISPR gRNA间隔序列比对

生物导体版本：释放（3.19）

提供用户友好的界面，使用领结绘制CRISPR gRNA间隔序列的靶向和非靶向图。这种比对速度很快，可以使用通用或定制的CRISPR核酸酶进行。这种比对可以用于任何参考或自定义基因组。支持DNA和RNA靶向核酸酶。

作者：Jean-Philippe Fortin[作者，作者]

维护人员：Jean-Philippe Fortin在gmail.com>

引文（从R中输入引文（“crisprBowtie”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“crisprBowtie”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“crisprBowtie”）

生物视图	对齐,CRISPR公司,功能基因组学,软件
版本	1.8.0
在生物导体中	生物柴油3.15（R-4.2）（2.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	方法
进口	生物遗传学,生物串,牛基因组,crispr底座(>= 0.99.15),基因组信息Db,基因组范围,I范围,勒波蒂,阅读器，统计，字符串，实用程序
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/crisprVerse/crisprBowtie
Bug报告	https://github.com/crisprVerse/crisprBowtie/issues

建议	生物风格,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38,针织物,rmarkdown公司,测试那个
链接到
增强功能
取决于我
导入我	crispr设计,清脆的诗句
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	crisprBowtie_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	crisprBowtie_1.8.0.zip
macOS二进制（x86_64）	crispr鲍蒂_1.8.0.tgz
macOS二进制（arm64）	crispr鲍蒂_1.8.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crisprBowtie网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/crisprBowtie
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/crispr鲍蒂/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/crisprBowtie网站/
软件包下载报告	下载统计信息