科塞克
序列数据的共表达分析
生物导体版本:释放(3.19)
高通量测序数据产生的表达谱的共表达分析。使用自适应变换和混合模型或K-means算法对特征(例如基因)轮廓进行聚类,并提供模型选择标准(以选择适当数量的簇)。
作者:安德烈亚·劳(Andrea Rau)[cre,aut]、凯西·毛吉斯·拉布绍(Cathy Maugis-Rabusseau)[ctb]、安托万·戈迪孔·巴吉奥尼(Antoine Godicon-Baggioni)[ctb]
维护人员:安德烈亚·劳(Andrea Rau)
安装
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如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“coseq”)
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文档
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浏览幻影(“coseq”)
细节
生物视图 |
基因表达式,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,软件 |
版本 |
1.28.0 |
在生物导体中 |
生物碳3.5(R-3.4)(7.5年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.0.0),总结性实验,S4载体 |
进口 |
边缘R,设计2,卡普什,Rmixmod公司,e1071号,BiocParallel公司,ggplot2,规模,HTS过滤器,校正图,HTS集群,gr设备,图形,统计,方法,成分,mvtnorm公司 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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程序包档案
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