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科塞克

序列数据的共表达分析


生物导体版本:释放(3.18)

高通量测序数据产生的表达谱的共表达分析。使用自适应变换和混合模型或K-means算法对特征(例如基因)轮廓进行聚类,并提供模型选择标准(以选择适当数量的簇)。

作者:安德烈亚·劳(Andrea Rau)[cre,aut]、凯西·毛吉斯·拉布绍(Cathy Maugis-Rabusseau)[ctb]、安托万·戈迪孔·巴吉奥尼(Antoine Godicon-Baggioni)[ctb]

维护人员:安德烈亚·劳(Andrea Rau)

引文(从R中输入引文(“coseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“coseq”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“coseq”)
科塞克 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因表达,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物活性炭3.5(R-3.4)(7年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.0.0),总结性实验,S4载体
进口 边缘R,DESeq2公司、capushe、Rmixmod、e1071、,生物并行,ggplot2,刻度,HTS过滤器、corrplot、HTSCluster、grDevices、图形、统计、方法、组成、mvtnorm
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 余弦_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 coseq_1.26.0.zip码
macOS二进制(x86_64) coseq_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) coseq_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coseq网址
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/coseq
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/coseq网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/coseq/
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