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集群实验

单细胞测序的比较聚类


生物导体版本:释放(3.19)

提供运行和比较单细胞测序数据或其他大型mRNA表达数据集的许多不同聚类的功能。

作者:伊丽莎白·普多姆[aut,cre,cph],戴维德·里索[aut]

维护人员:Elizabeth Purdom<epurdom at stat.berkeley.edu>

引文(从R中输入引文(“集群实验”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“集群实验”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“集群实验”)
集群实验渐晕 HTML格式 R脚本
使用大型数据集 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 群集,RNA序列,排序,单个单元格,软件
版本 2.24.0
在生物导体中 生物柴油3.4(R-3.3)(7.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.6.0),单细胞实验,总结性实验(>= 1.15.4),生物遗传学
进口 方法,国家气象局,R彩色啤酒,(>= 5.0),集群,统计,利马,位置传感器,矩阵统计,图形,并行,BiocSingular公司,内核实验室,字符串,S4载体,gr设备,延迟阵列(>= 0.7.48),HDF5阵列(>= 1.7.10),矩阵,卢比,边缘R,规模,锌波,藻糖酶,普拉克马,mbkmeans公司
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/epurdom/clusterExperiment/issues
查看更多
建议 仿生风格,针织物,测试那个,桅杆,Rtsne公司,尖叫声,记录仪,rmarkdown公司
链接到 卢比
增强功能
取决于我 网络平滑
导入我
建议我 净Dx,弹弓,tradeSeq(交易序列)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 集群实验_2.24.0.tar.gz
Windows二进制 集群实验_2.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) 集群实验_2.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) 集群实验_2.24.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cluster实验
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/群集实验
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/clusterExperiment(网址:https://code.bioconductor.org/browse/clusterExperiment)/
包短Url https://bioconductor.org/packages/cluster实验/
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