芯片序列

chipseq：分析chipseq数据的包

生物导体版本：释放（3.19）

用于帮助处理chipseq实验的短读取数据的工具。

作者：Deepayan Sarkar[aut]、Robert Gentleman[aut'、Michael Lawrence[aut]、Zizhen Yao[aut]、Oluwabukola Bamigbade[ctb]（从Swave转换为R Markdown/HTML的vignette）、Bioconductor Package Maintainer[cre]

维护人员：生物导体包维护者<Bioconductor.org上的维护者>

引文（从R中输入引文（“chipseq”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“chipseq”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“芯片序列”）

ChIP-Seq数据的一些基本分析	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式

需要帮助吗？请访问生物导体支持网站！

细节

生物视图	ChIPSeq公司,新闻报道,数据导入,质量控制,排序,软件
版本	1.54.0
在生物导体中	生物碳2.5（R-2.10）（14.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.5.0），方法，生物遗传学(>= 0.1.0),S4载体(>= 0.17.25),I范围(>= 2.13.12),基因组范围(>= 1.31.8),ShortRead（短阅读）
进口	方法、统计信息、，晶格,生物遗传学,I范围,基因组范围,ShortRead（短阅读）
系统要求
统一资源定位地址

建议	牛基因组,基因组特征,发送数据库。Mmusculus。UCSC.mm9.known基因,英国基因组。姆穆苏卢斯。UCSC毫米9,仿生风格,针织者
链接到
增强
取决于我
导入我	中国药监会,HTSeqGenie软件,soGGi公司,转录本R
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	芯片序列_1.54.0.tar.gz
Windows二进制	chipseq_1.54.0.zip码（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	芯片序列_1.54.0.tgz
macOS二进制（arm64）	芯片序列_1.54.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipseq
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/chipseq
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/chipseq/
包短Url	https://bioductor.org/packages/chipseq/
软件包下载报告	下载统计信息