饼干商

饼干的便利功能

生物导体版本：释放（3.19）

饼干输出的bsseq加载的测试工具，定义区域和可映射样本中WGBS数据的汇总，有无插补，删除大部分NA行，年龄估计等。

作者：蒂姆·特里希[aut]，周婉婷[aut].本杰明·约翰逊[aut'，雅各布·莫里森[aut，cre]，Lyong Heo[aut:

维护人员：雅各布·莫里森<Jacob.Morrison at vai.org>

引文（从R中输入引文（“饼干匠”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“饼干匠”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignettes（“饼干商”）

生物视图	脱氧核糖核酸甲基化,数据导入,甲基Seq,软件
版本	1.18.0
在生物导体中	生物C 3.10（R-3.6）（4.5年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=4.1.0），饼干商数据,bsseq公司
进口	阅读器,质量V,矩阵,插补,HDF5阵列,S4载体,Rsamtools软件,数据表,博科生物,基因组范围,I范围,生物遗传学,变量注释,延迟矩阵统计,总结性实验,基因组信息Db,穆斯库卢斯,猿人,矩阵统计,rtracklayer公司,QDNAseq公司,数据管理服务、方法、实用程序，R.utils公司,gtools（工具）,生物并行
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/trichelab/cookiceer（https://github.com/trichelab/cookier）
错误报告	https://github.com/trichelab/cousiceer/issues

建议	决策支持系统,冠状病毒,针织物,rmarkdown公司,降价,爱尔兰航空公司,scmeth公司,pkg向下,氧气2,测试那个,QDNA序列hg19,QDNA序列.mm10,仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	饼干工_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	饼干工_1.18.0.zip
macOS二进制（x86_64）	饼干工_1.18.0.tgz
macOS二进制（arm64）	饼干工_1.18.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/饼干
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/饼干商
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cousizeer/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/饼干商/
软件包下载报告	下载统计信息