TBSignatureProfiler（签名档案器）
使用TB路径特征分析RNA-Seq数据
生物导体版本：释放（3.19）
结核病进展、结核病和其他结核病状态的基因特征已经过验证和发表。这个包聚合了已知的签名，并提供了计算工具来登记它们在其他数据集上的使用。TBSignatureProfiler可以使用这些特征轻松分析RNA-Seq数据，并包括常见的特征分析工具，包括ASSIGN、GSVA和ssGSEA。一些基因签名的原始模型也可用。一个闪亮的应用程序除了提供一些功能外，还提供了详细的命令行可访问性。
作者：奥布里·R·奥多姆〔aut，cre，dtm〕
，大卫·詹金斯[aut，org]，王旭涛[aut]，赵岳[ctb]，Christian Love[ctb]，W.Evan Johnson[aut]
维护人员：奥布里·奥多姆（Aubrey R.Odom）
引文（从R中输入引文（“TBSignatureProfiler”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“TBSignatureProfiler”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“TBSignatureProfiler”）
细节
| 生物视图 |
差异表达式,基因表达式,软件 |
| 版本 |
1.16.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.11（R-4.0）（4.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.2.0） |
| 进口 |
分配(>= 1.23.1),BiocParallel公司,复杂热图,设计2,DT公司,边缘R,格达塔,ggplot2,GSVA公司(>= 1.51.3),马格里特、方法、，R彩色啤酒,重塑2,爱尔兰航空公司,ROCit公司,S4载体,单一得分，统计，总结性实验 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/wejlab/TBSignatureProfiler（https://github.com/wejlab/TBSignatureProfiler） https://wejlab.github.io/TBSignatureProfiler文档/ |
| 错误报告 |
https://github.com/wejlab/TBSignatureProfiler/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
仿生风格,插入符号,绕圈子,班,覆盖（covr）,数字播放器,e1071号,格尔姆奈特,HGNC助手,插补,针织物,短绒,MASS（质量）,普利尔,pROC公司,随机森林,市场营销,闪亮的,拼写,特别行政区,测试那个 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
