分配

自适应签名选择与积分（ASSIGN）

生物导体版本：释放（3.18）

ASSIGN是一种计算工具，用于评估个体患者样本中的路径解除管制/激活状态。ASSIGN采用灵活的贝叶斯因子分析方法，将基于知识的文献或扰动实验中得出的预定路径特征适应于细胞/组织特定的路径特征。每个特定环境路径的解除管制/激活水平量化为一个分数，表示患者样本包含路径解除管制/活化特征的程度。

作者：沈颖（Ying Shen）、安德烈亚·比尔德（Andrea H.Bild）、W.埃文·约翰逊（W.Evan Johnson）和穆特赫娜·拉赫曼（Mumthena Rahman）

维护人员：Ying Shen＜yshen3 at bu.edu>，W.Evan Johnson＜wej at bu.edu>，David Jenkins＜dfj at bu.edu>，Mumthena Rahman＜moom.Rahman at utah.edu>

引文（从R中输入引文（“ASSIGN”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.软件包（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“分配”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“分配”）

生物视图	贝叶斯主义者，基因表达式，路径，软件
版本	1.38.0
在生物导体中	生物技术2.14（R-3.1）（10年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.4）
进口	gplots、图形、grDevices、msm、Rlab、stats、，特别行政区、utils、ggplot2、yaml
系统要求
统一资源定位地址	https://compbiomed.github.io/ASSIGN网站/
错误报告	https://github.com/compbiomed/ASSIGN/issues网站

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	任务_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	分配_1.38.0.zip
macOS二进制（x86_64）	任务_1.38.0.tgz
macOS二进制（arm64）	分配_1.38.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASSIGN
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/ASSIGN
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ASSIGN网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/ASSIGN/
软件包下载报告	下载统计信息