冲浪者
表面蛋白预测与鉴定
生物导体版本:释放(3.19)
从候选基因列表中识别表面蛋白编码基因。系统地从GEO和TCGA下载数据或使用您自己的数据。对批量RNAseq数据执行DGE。执行Meta分析。描述性富集分析和绘图。
作者:奥罗拉·毛里齐奥[aut,cre],安娜·索菲亚·塔西尼[aut,ctb]
维护人员:Aurora Maurizio<auroramaurizio1 at gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“SurfR”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“冲浪者”)
细节
生物视图 |
BatchEffect(批次效果),数据导入,差异表达式,功能基因组学,功能预测,GO(开始),基因表达式,基因预测,GeneSet扩展,路径,主要组件,RNA序列,排序,软件,转录,可视化 |
版本 |
1.0.0 |
在生物导体中 |
生物活性碳3.19(R-4.4)(<6个月) |
许可证 |
GPL-3+文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.3.0) |
进口 |
高温气冷堆,生物文件缓存,仿生风格,SPsimSeq软件,设计2,边缘R,开放式xlsx,字符串,rhdf5型,ggplot2,gg排斥,统计,马格里特,资产占有人,第三年,数字播放器,TCG生物链,生物反应器,metaRNA序列,丰富R,规模,文恩,额外网格,总结性实验,针织物,gr设备,图形,实用程序 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/auroramaurizio/SurfR |
错误报告 |
https://github.com/auroramaurizio/SurfR/issues |
查看更多
建议 |
测试那个(>= 3.0.0) |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
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建议我 |
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指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。