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RUVSeq公司

从RNA-Seq数据中删除不需要的变化


生物导体版本：释放（3.19）

该软件包实现了Risso等人（2014）的去除不需要的变异（RUV）方法，用于规范化样本之间的RNA-Seq读取计数。

作者：大卫·里索[aut，cre，cph]，桑德琳·杜多特[aut]，洛伦娜·潘塔诺[ctb]，卡米尔·斯洛维科夫斯基[ctb]

维护人员：Davide Risso<gmail.com上的Risso.Davide>

引文（从R中输入引文（“RUVSeq”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“RUVSeq”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“RUVSeq”）
RUVSeq：从RNA-Seq数据中删除不需要的变化 HTML格式 R脚本
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细节

生物视图 差异表达式,免疫肿瘤学,预处理,RNA序列,软件
版本 1.38.0
在生物导体中 生物技术3.0（R-3.1）（10年）
许可证 艺术-2.0
取决于 博科生物,EDASeq公司(>= 1.99.1),边缘R
进口 方法，MASS（质量）
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/drisso/RUVSeq
错误报告 https://github.com/drisso/RUVSeq/issues
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取决于我 八进制,rna序列基因
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 RUVSeq_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 RUVSeq_1.38.0.zip码
macOS二进制（x86_64） RUVSeq_1.38.0.tgz
macOS二进制（arm64） RUVSeq_1.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RUVSeq
源存储库（开发人员访问） git克隆git@git.bioconductor.org：包/RUVSeq
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/RUVSeq网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/RUVSeq网站/
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