REMP公司
重复元素甲基化预测
生物导体版本：释放（3.19）
基于机器学习的工具，通过学习周围的遗传和表观遗传信息来预测局部特异性重复元件（RE）的DNA甲基化。这些工具为RE上的DNA甲基化预测提供了全基因组和单碱基分辨率，使用基于阵列或基于序列的平台很难测量这些分辨率，这使得RE上的表观基因组关联研究（EWAS）和差异甲基化区域（DMR）分析成为可能。
作者：郑一南[aut，cre]，刘雷[aut]，张伟[aut]Warren Kibbe[aut'，侯立芳[aut、cph]
维护人员：伊南郑<y-Zheng at northwesth.edu>
安装
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if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“REMP”）
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文档
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细节
| 生物视图 |
DNA甲基化,数据导入,差异甲基化,表观遗传学,基因组广泛协会,甲基化阵列,微阵列,多通道,预处理,质量控制,排序,软件,双通道 |
| 版本 |
1.28.0 |
| 在生物导体中 |
生物碳3.5（R-3.4）（7.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=3.6），总结性实验(>= 1.1.6),米菲(>= 1.22.0) |
| 进口 |
阅读器,rtracklayer公司，图形，统计，实用程序，方法，设置,生物遗传学,S4载体,生物串,基因组范围,I范围,基因组信息Db,生物并行,do并行，平行，foreach公司,插入符号,内核实验室,护林员,牛基因组,批注中心,组织Hs.eg.db,插补,迭代器 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/伊南正/REMP |
| Bug报告 |
https://github.com/伊南正/REMP/issues |
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程序包档案
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