MungeSumstats公司
标准化GWAS的汇总统计数据
生物导体版本：释放（3.19）
*MungeSumstats*包旨在促进GWAS汇总统计数据的标准化。它重新格式化输入的汇总统计数据，以包括SNP、CHR、BP，并可以在缺少任何值时查找这些值。它还规定了数十个质量控制和过滤步骤，以确保高数据质量并将研究间差异降至最低。
作者：阿兰·墨菲
，Brian Schilder[aut，ctb]，内森·斯凯恩[aut]
维护人员：阿兰·墨菲（Alan Murphy）<alanmurph94，网址：hotmail.com>
引文（从R中输入引文（“MungeSumstats”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MungeSumstats”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“MungeSumstats”）
细节
| 生物视图 |
比较基因组学,遗传学,基因组广泛协会,基因组变异,预处理,SNP公司,软件,全基因组 |
| 版本 |
1.12.2 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.13（R-4.1）（3.5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.1） |
| 进口 |
马格里特,数据表，实用程序，R.utils公司,数字播放器，统计，基因组范围,I范围,基因组信息Db,牛基因组,生物串,字符串,变量注释,谷歌作者,高温气冷堆,jsonlite公司，方法，并行，rtracklayer公司(>= 1.59.1),RCurl（RCurl） |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/neurogenomics/MungeSumstats网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/neurogenomics/MungeSumstats/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
SNPlocs公司。Hsapiens.dbSNP144.GRCh37型,SNPlocs公司。Hsapiens.dbSNP144.GRCh38型,SNPlocs公司。Hsapiens.dbSNP155.GRCh37型,SNPlocs公司。Hsapiens.dbSNP155.GRCh38型,英国基因组。人乳头状瘤病毒1000个基因组。人乳头状瘤病毒37天5,英国基因组。哈皮恩斯。NCBI。GRCh38型,生物遗传学,S4载体,rmarkdown公司,降价,针织物,测试那个(>= 3.0.0),UpSetR（升级程序）,仿生风格,冠状病毒,Rsamtools软件,矩阵泛型,獾,生物并行,基因组文件 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
