MethReg公司
评估DNA甲基化区域或位点对基因转录的调节潜力
生物导体版本：释放（3.19）
全表观基因组关联研究（EWAS）检测到大量DNA甲基化差异，通常是数百个差异甲基化区域和数千个CpG，它们与疾病显著相关，许多位于非编码区域。因此，迫切需要更好地了解这些CpG甲基化的功能影响，并进一步优先考虑重大变化。MethReg是一个R包，用于DNA甲基化、靶基因表达和转录因子结合位点数据的集成建模，以系统地识别和排序功能性CpG甲基化。MethReg使用匹配的甲基化和基因表达数据，以及基于手动筛选、ChIP-seq实验或基因调控网络分析的外部TF靶点交互数据库，评估、优先排序并注释具有高调控潜力的CpG位点。
作者：蒂亚戈·席尔瓦[aut，cre]
，Lily Wang[作者]
维护人员：蒂亚戈·席尔瓦
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MethReg”）
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文档
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细节
| 生物视图 |
表观遗传学,基因表达式,基因目标,甲基化阵列,回归,软件,转录 |
| 版本 |
1.14.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.0） |
| 进口 |
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| 系统要求 |
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| 网址 |
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| 错误报告 |
https://github.com/TransBioInfoLab/MethReg/issues网站/ |
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程序包档案
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