MIRit公司
整合microRNA和基因表达以破译路径复杂性
生物导体版本：释放（3.19）
MIRit是一个R包，它提供了几种方法来研究miRNAs和基因在不同生物条件下的关系。特别是，MIRit可以探索失调miRNA的功能，并使识别控制生物通路的miRNA-gene调控轴成为可能，从而使用户能够揭示miRNA生物学的复杂性。MIRit是一个多合一框架，旨在帮助研究人员进行从差异表达分析到网络表征的miRNA-mRNA综合分析的所有核心方面。
作者：雅各布·隆奇[aut，cre]
，玛丽亚·福蒂[fnd]
维护人员：雅各布·隆奇（Jacopo Ronchi）
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MIRit”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“MIRit”）
细节
| 生物视图 |
差异表达式,表观遗传学,功能基因组学,基因表达式,基因调控,网络,网络丰富,网络推理,路径,软件,系统生物学 |
| 版本 |
1.0.0 |
| 在生物导体中 |
生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月） |
| 许可证 |
GPL（>=3） |
| 取决于 |
多重分析实验，R（>=4.4.0） |
| 进口 |
注释Dbi,生物文件缓存,BiocParallel公司,设计2,边缘R,fgsea公司,基因基特,基因集,ggplot2,ggpubr公司,图表、图形、，石墨，gr设备，高温气冷堆,利马、方法、，卢比,读xl,Rgraphviz公司(>= 2.44.0),爱尔兰航空公司，统计，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/jacopo-ronchi/MIRit |
| 错误报告 |
https://github.com/jacopo-ronchi/MRIt/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
仿生风格,生物反应器,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38,基因组范围,gg排斥,ggridges公司,Gviz公司,格瓦斯拉皮德,针织物,单聚物,组织Hs.eg.db,rmarkdown公司,测试那个(>= 3.0.0) |
| 链接到 |
卢比 |
| 增强功能 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
