MEDIPS公司
DNA IP-seq数据分析
生物导体版本：释放（3.19）
MEDIPS用于分析甲基化DNA免疫沉淀（MeDIP）实验所得数据，然后进行测序（MeDIP-seq）。然而，MEDIPS提供了分析任何类型定量测序数据（例如ChIP-seq、MBD-seq、CMS-seq和其他）的功能，包括计算样本组之间的差异覆盖率以及饱和度和相关性分析。
作者：卢卡斯·查韦斯、Matthias Lienhard、Joern Dietrich、Isaac Lopez Moyado
维护人员：卢卡斯·查韦斯
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MEDIPS”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
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细节
| 生物视图 |
ChIPSeq公司,副本编号变化,新闻报道,CpGIsland公司,DNA甲基化,差异表达式,遗传学,基因组注释,微阵列,预处理,质量控制,序列匹配,排序,软件,可视化 |
| 版本 |
1.56.0 |
| 在生物导体中 |
生物碳2.7（R-2.12）（14年） |
| 许可证 |
GPL（>=2） |
| 取决于 |
R（>=3.0），牛基因组,Rsamtools软件 |
| 进口 |
基因组范围,生物串、图形、，gtools公司,I范围，方法，统计，实用程序，边缘R,DNA拷贝,生物反应器,rtracklayer公司,预处理核心 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
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