用餐

执行甲基化分析

生物导体版本：释放（3.19）

封装以集成甲基化和表达数据。它还可以单独进行甲基化或表达分析。包括几个绘图功能以及基于冗余分析的新区域分析。也可以估计SNP对某一地区的影响。

作者：卡洛斯·鲁伊斯·阿雷纳斯[aut，cre]，胡安·冈萨雷斯[aut]

维护人员：Xavier EscribáMontagut<isglobal.org上的Xavier.esciba>

引文（从R中输入引文（“MEAL”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“用餐”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“用餐”）

生物视图	DNA甲基化,微阵列,软件,全基因组
版本	1.34.0
在生物导体中	生物技术3.2（R-3.2）（8.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.6.0），博科生物,多数据集
进口	基因组范围,利马、素食主义者、，生物遗传学,米菲,I范围,S4载体，方法，并行，ggplot2（>=2.0.0），排列，Gviz公司,甲基错误，isva，总结性实验、SmartSVA、图形、统计、实用程序、矩阵统计
系统要求
统一资源定位地址

建议	测试，Illumina人甲基化EPICanno.ilm10b2.hg19,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19公司、knitr、，minfiData公司,仿生风格、rmarkdown、，brge数据
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包	MEAL_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	MEAL_1.34.0.zip餐点
macOS二进制（x86_64）	MEAL_1.34.0.tgz
macOS二进制（arm64）	MEAL_1.34.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MEAL网址
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：套餐/餐
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MEAL网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MEAL网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档