MADSEQ公司
基于大规模并行测序数据的镶嵌非整倍体检测与量化
生物导体版本：释放（3.19）
MADSEQ软件包提供了一组分层Bayesan模型，用于检测镶嵌非整倍体、推断非整倍性类型以及量化样本中非整倍细胞的比例。
作者：Yu Kong、Adam Auton、John Murray Greally
维护人员：于刚（Yu.Kong）在爱因斯坦（einstein.Yu.edu）博士学位
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MADSEQ”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“MADSEQ”）
细节
| 生物视图 |
贝叶斯主义者,副本编号变化,新闻报道,基因组变异,排序,软件,体细胞突变,变量检测 |
| 版本 |
1.30.0 |
| 在生物导体中 |
生物化学3.4（R-3.3）（8年） |
| 许可证 |
GPL（>=2） |
| 取决于 |
R（>=3.5.0），罗杰斯(>= 4.6) |
| 进口 |
VGAM公司,尾波,牛基因组,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,S4载体、方法、，预处理核心,基因组比对,Rsamtools软件,生物串,基因组范围,I范围,变量注释,总结性实验,基因组信息Db,rtracklayer公司、图形、统计、grDevices、utils、，zlibbico公司,录像机 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/ykong2/MADSEQ网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/ykong2/MADSEQ/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
针织物 |
| 链接到 |
|
| 增强功能 |
|
| 取决于我 |
|
| 导入我 |
|
| 建议我 |
|
| 链接到我 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
