HiTC公司

高通量染色体构象捕获分析

生物导体版本：释放（3.19）

HiTC包的开发是为了探索高通量的“C”数据，如5C或Hi-C。还提供了专用的R类以及质量控制、规范化、可视化和进一步分析的标准方法。

作者：尼古拉斯仆人

维护人员：尼古拉斯仆人<Nicolas.Servant at curie.fr>

引文（从R中输入引文（“HiTC”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“HiTC”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“HiTC”）

生物视图	HiC公司,高通量排序,排序,软件
版本	1.48.0
在生物导体中	生物技术2.10（R-2.15）（12.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=2.15.0）、方法，I范围,基因组范围
进口	生物串、图形、grDevices、，rtracklayer公司,R彩色啤酒,矩阵，平行，基因组信息Db
系统要求
统一资源定位地址

建议	生物风格,HiCDataHumanIMR90,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg18
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	HiCDCPlus公司,HiCDataHumanIMR90,形容词
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	HiTC_1.48.0.tar.gz
Windows二进制	HiTC_1.48.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	HiTC_1.48.0.tgz
macOS二进制（arm64）	高TC_1.48.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiTC
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/HiTC
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/HiTC/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/HiTC/
软件包下载报告	下载统计信息