HTSeqGenie软件
NGS分析管道。
生物导体版本：释放（3.19）
库执行NGS分析。
作者：Jens Reeder Gregoire Pau
维护人员：Jens Reeder<Reeder.Jens at gene.com>
引文（从R中输入引文（“HTSeqGenie”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“HTSeqGenie”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“HTSeqGenie”）
细节
| 生物视图 |
软件 |
| 版本 |
4.34.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术2.11（R-2.15）（12年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=3.5.0），gmapR（gmapR）(>= 1.8.0),短读(>= 1.19.13),变量注释(>= 1.8.3) |
| 进口 |
生物遗传学(>= 0.2.0),S4载体(>= 0.9.25),I范围(>= 1.21.39),基因组范围(>= 1.23.21),Rsamtools软件(>= 1.8.5),生物串(>= 2.24.1),pwalling（pwallign）,芯片序列(>= 1.6.1),h写入程序(>= 1.3.0),开罗(>= 1.5.5),基因组特征(>= 1.9.31),生物并行、并联、工具，rtracklayer公司(>= 1.17.19),基因组比对,变量工具(>= 1.7.7),基因组信息Db,总结性实验，方法 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
