GWA工具
全基因组关联研究工具
生物导体版本:释放(3.19)
用于存储超大GWAS数据集和注释的类,以及用于GWAS数据清理和分析的函数。
作者:Stephanie M.Gogarten[aut]、Cathy Laurie[aut]、Tushar Bhangale[aut'、Matthew P.Conomos[aut]]、Cecelia Laurie[aut],Michael Lawrence[aut〕、Caitlin McHugh[aut】、Ian Painter[aut4]、Xiuwen Zheng[autneneneea、Jess Shen[aut]、Rohit Swarnkar[aut2]、Adrienne Stilp[aut;、Sarah Nelson[autneneneei]、David Levine[auc]、Sonali Kumari[ctb](将小插曲从Sweave转换为RMarkdown/HTML。),Stephanie M.Gogarten[cre]
维护人员:斯蒂芬妮·戈加滕(Stephanie M.Gogarten)
引文(从R中输入引文(“GWASTools”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“GWASTools”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“GWA工具”)
细节
生物视图 |
遗传变异性,微阵列,质量控制,SNP公司,软件 |
版本 |
1.50.0 |
在生物导体中 |
BioC 2.9(R-2.14)(13年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
博科生物 |
进口 |
图形、统计、实用程序、方法、,gdsfmt公司,数据库接口,RSQ网站,GWASExactHW公司,DNA副本,生存,三明治,lmtest测试,后勤人员,量子平滑,数据表 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/smgogarten/GWA工具 |
查看更多
建议 |
ncdf4型,GWAS数据,生物遗传学,RUnit(运行单位),生物串,基因组范围,I范围,SNP关联,snpStats(snpStat),S4载体,变量注释,平行,仿生风格,针织物 |
链接到 |
|
增强功能 |
|
取决于我 |
百万BPCR,GWAS数据,窃听 |
导入我 |
起源,gwasurvr公司 |
建议我 |
podkat公司 |
链接到我 |
|
生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。