起源
结构化样本中的基因估计和推断（GENESIS）：分析具有种群结构和/或相关性样本中遗传数据的统计方法
生物导体版本：释放（3.18）
GENESIS软件包提供了在遗传分析中估算、推断和解释种群和系谱结构的方法。当前的实现提供了执行PC-AiR（Conomos等人，2015年，Gen Epi）和PC-Relate（Conomas等人，2016年，AJHG）的功能。PC-AiR对全基因组SNP数据进行主成分分析，以检测可能包含已知或隐秘相关性的样本中的种群结构。与标准PCA不同，PC-AiR解释了样本中的相关性，以提供准确的血统推断，而不会受到家庭结构的干扰。PC-Relate使用祖先代表性主成分来调整种群结构/祖先，并准确估计最近的遗传相关性度量，如亲属系数、IBD共享概率和近交系数。此外，还提供了对定量和二进制表型进行有效方差分量估计和混合模型关联测试的功能。
作者：马修·科诺莫斯（Matthew P.Conomos）、斯蒂芬妮·戈加顿（Stephanie M.Gogarten）、丽莎·布朗（Lisa Brown）、韩晨（Han Chen）、托马斯·伦利（Thomas Lumley）、肯尼思·赖斯（Kenneth Rice）、塔玛·索弗（Tamar Sofer）、阿德里
维护人员：斯蒂芬妮·戈加滕（Stephanie M.Gogarten）
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“基因”）
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文档
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细节
| 生物视图 |
生物视图,尺寸缩减,遗传变异性,遗传学,基因组广泛协会,主要组件,质量控制,SNP公司,软件,统计方法 |
| 版本 |
2.32.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.1（R-3.2）（9年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
|
| 进口 |
博科生物,生物遗传学,生物并行,GWA工具,gdsfmt公司,基因组学范围,I范围,S4载体,SeqArray（序列阵列）,SeqVarTools（序列变量工具）,SNP关联，data.table，graphics，grDevices，igraph，Matrix，methods，reformate2，stats，utils |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/UW-GAC/GENESIS网站 |
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程序包档案
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