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生物检测

生物导体特定包装检查


生物导体版本:释放(3.19)

BiocCheck通过Bioconductor最佳实践指导维护人员。它通过搜索包代码、示例和渐晕图来运行Bioconductor特定的包检查。维修人员需要处理所有错误、警告和生成的大多数注释。

作者:生物导体组件维护人员[aut]、洛丽·谢泼德[aut]Daniel von Twisk[ctb]、凯文·鲁[ctb]Marcel Ramos[aut,cre]莱昂纳多·科拉多·托雷斯

维护人员:马塞尔·拉莫斯<Marcel.Ramos at roswellpark.org>

引文(从R中输入引文(“BiocCheck”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“BiocCheck”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“BiocCheck”)
BiocCheck:确保生物导体包装指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基础设施,软件
版本 1.40.0
在生物导体中 生物技术2.14(R-3.1)(10年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.3.0)
进口 BiocBaseUtils公司,生物文件缓存,生物技术经理,生物视图(>= 1.33.7),呼叫者,编码工具,图表,高温气冷堆2,针织物、方法、,服务器,字符串主义者,工具,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/Bioconductor/BiocCheck网站
错误报告 https://github.com/Bioconductor/BiocCheck/issues网站
查看更多
建议 RUnit(运行单位),生物遗传学,博科生物,jsonlite公司,rmarkdown公司,下载器,开发工具(>= 1.4.1),用这个,仿生风格,基因组范围,格特
链接到
增强功能
取决于我
导入我 注释中心数据,gDR样式
建议我 GEOfastq公司,光谱TAD,packFinder(包查找器),精确TAD,HMP16S数据,HMP2数据,scpdata数据,主要现有数据集
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 生物检查_1.40.0.tar.gz
Windows二进制 生物检查_1.40.0.zip
macOS二进制(x86_64) 生物检查_1.40.0.tgz
macOS二进制(arm64) 生物检查_1.40.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocCheck(生物检测)
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/BiocCheck
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BiocCheck网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/BiocCheck(生物检测)/
软件包下载报告 下载统计信息