生物检测
生物导体特定包装检查
生物导体版本:释放(3.19)
BiocCheck通过Bioconductor最佳实践指导维护人员。它通过搜索包代码、示例和渐晕图来运行Bioconductor特定的包检查。维修人员需要处理所有错误、警告和生成的大多数注释。
作者:生物导体组件维护人员[aut]、洛丽·谢泼德[aut]Daniel von Twisk[ctb]、凯文·鲁[ctb]Marcel Ramos[aut,cre]莱昂纳多·科拉多·托雷斯
维护人员:马塞尔·拉莫斯<Marcel.Ramos at roswellpark.org>
引文(从R中输入引文(“BiocCheck”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“BiocCheck”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“BiocCheck”)
细节
生物视图 |
基础设施,软件 |
版本 |
1.40.0 |
在生物导体中 |
生物技术2.14(R-3.1)(10年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.3.0) |
进口 |
BiocBaseUtils公司,生物文件缓存,生物技术经理,生物视图(>= 1.33.7),呼叫者,编码工具,图表,高温气冷堆2,针织物、方法、,服务器,字符串主义者,工具,实用程序 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/Bioconductor/BiocCheck网站 |
错误报告 |
https://github.com/Bioconductor/BiocCheck/issues网站 |
查看更多
建议 |
RUnit(运行单位),生物遗传学,博科生物,jsonlite公司,rmarkdown公司,下载器,开发工具(>= 1.4.1),用这个,仿生风格,基因组范围,格特 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
注释中心数据,gDR样式 |
建议我 |
GEOfastq公司,光谱TAD,packFinder(包查找器),精确TAD,HMP16S数据,HMP2数据,scpdata数据,主要现有数据集 |
指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。