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HMP16S数据

人类微生物组项目的16S rRNA测序数据


生物导体版本:释放(3.18)

HMP16SData是人类微生物组项目(HMP)16S rRNA可变区1-3和3-5的测序数据的Bioconductor ExperimentData包。原始数据文件在从HMP数据分析和协调中心下载的包中提供。处理后的数据通过ExperimentHub作为SummarizedExperiment类对象提供。

作者:卢卡斯·希弗、里姆沙·阿扎尔[aut]、马塞尔·拉莫斯[ctb]、路德维希·盖斯林格[ctb'、列维·沃尔德龙[aut'

维护人员:卢卡斯·希弗(Lucas schiffer)<schiffer.Lucas at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“HMP16SData”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“HMP16SData”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“HMP16SData”)
HMP16S数据 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 实验数据,实验中心,人乳头数据,微生物数据,可复制研究,排序数据
版本 1.22.0
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.1.0),总结性实验
进口 批注中心,实验中心,S4载体,assertthat,dplyr,kableExtra,knitr,magrittr,methods,readr,stringr,tibble,utils
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/waldronlab/HMP16SData
错误报告 https://github.com/waldronlab/HMP16SData/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 HMP16S数据_1.22.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HMP16SData
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/HMP16SData
包短Url https://bioconductor.org/packages/HMP16SData/
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