SUPERFAMILY 1.75 HMM库和基因组分配服务器

SUPERFAMILY 2可从supfam.org。拜托联系我们如果你遇到任何问题。


琥珀酰辅酶A合成酶,β链,N末端结构域家族

SCOP分类
根目录: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: α和β蛋白(a+b)[ 53931](376)
折叠: ATP抓取[ 56058] (2)
超级家族: 谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样[ 56059] (9)
家庭:   琥珀酰辅酶A合成酶,β链,N末端结构域[56081个]


家庭统计
基因组(2,316) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
2,741 18,620 5
蛋白质 2738个 18,610 5


酶委员会(EC)

(
显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEO水平注释(直接或继承)
酶委员会(EC)连接酶类0信息最少直接
酶委员会(EC)ATP柠檬酸合成酶0.0000000000004541高度信息化直接
酶委员会(EC)酸-硫醇连接酶1高度信息化继承的

文档:SCOP域的EC注释

苍蝇表型(FP)

(显示详细信息)
FP术语FDR(全部)SDFP级别注释(直接或继承)
苍蝇表型(FP)死亡率增加0信息最少直接

文档:SCOP域的FP注释

拟南芥植物本体(AP)

(显示详细信息)
AP术语FDR(全部)SDAP级别注释(直接或继承)
植物非原子实体(PAN)叶尖0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)分生组织部分0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)种子0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)雌蕊0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)叶片0信息最少直接
工厂原子实体(PAN)植物胚胎0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)大孢子叶0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)小配子体0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)孢子囊0信息最少直接
工厂原子实体(PAN)茎节间0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)花瓣0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)雄蕊群0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)集体叶结构0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)芽尖0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)花序0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)萼片0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)分支0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)维管叶0信息最少直接
工厂原子实体(PAN)小孢子叶0信息最少直接
工厂原子实体(PAN)0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)D双边阶段0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)4叶衰老期0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)F成熟胚期0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)LP.04四叶可视台0信息最少直接
厂房结构开发阶段(PDE)LP.02二叶可视台0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)LP.12十二叶可视舞台0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)LP.08八叶可视台0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)LP.10十叶可视舞台0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)E膨大子叶期0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)LP.06六叶可视舞台0信息最少直接
工厂结构开发阶段(PDE)C球状阶段0信息最少直接

文档:SCOP域的AP注释

酶委员会(EC)

(显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEC级注释(直接或继承)
酶委员会(EC)转移酵素1信息最少继承的
酶委员会(EC)连接酶类0信息量适中直接
酶委员会(EC)酰基转移酶1信息量适中继承的
酶委员会(EC)转移时酰基转化为烷基0.001978高度信息化继承的

文档:SCOP域的EC注释

跳转到[页面顶部·SCOP分类·酶委员会(EC)·苍蝇表型(FP)·拟南芥植物本体(AP)·酶委员会(EC)]

内部数据库链接

   
超级家庭级别 家庭级别

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于在超家族水平上将SCOP结构域分配给所有基因组。


   
超级家庭级别 家庭层面

序列对齐60种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或粘贴或上传您自己的序列。


超级家庭级别

浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合,包括谷胱甘肽合成酶ATP结合结构域样结构域。


   
超级家庭级别 家庭层面

检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


跳转到[页面顶部·SCOP分类·酶委员会(EC)·苍蝇表型(FP)·拟南芥植物本体(AP)·酶委员会(EC)·内部数据库链接]