SUPERFAMILY 1.75 HMM库和基因组分配服务器

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突触蛋白C末端结构域家族

SCOP分类
根目录: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: α和β蛋白(a+b)[ 53931] (376)
折叠: ATP抓取[ 56058] (2)
超级家族: 谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样[ 56059] (9)
家庭:   突触蛋白C末端结构域[ 56078] (2)


家庭统计
基因组学(135) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
323 802
蛋白质类 321 801


疾病本体(DO)

(
显示详细信息)
DO术语FDR(全部)SDDO级别注释(直接或继承)
疾病本体(DO)心理健康疾病0信息量适中直接
疾病本体(DO)精神分裂症0信息直接

文档:SCOP域的DO注释

小鼠表型(MP)

(显示详细信息)
MP术语FDR(全部)SDMP级别注释(直接或继承)
哺乳动物表型(MP)神经系统表型0信息最少直接
哺乳动物表型(MP)异常突触传递0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)神经元形态异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)神经系统发育异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)异常行为1信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)异常神经系统电生理学0信息直接
哺乳动物表型(MP)异常学习/记忆/条件反射0信息直接
哺乳动物表型(MP)异常情绪/情感行为0信息直接
哺乳动物表型(MP)中枢神经系统突触传递异常0信息直接
哺乳动物表型(MP)癫痫发作0信息直接
哺乳动物表型(MP)突触抑制增加0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)异常的社会/同种互动0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)异常攻击相关行为0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)强直阵挛性癫痫0高度信息化直接

文档:SCOP域的MP注释

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内部数据库链接

   
超级家庭级别 家庭层面

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。


   
超级家庭级别 家庭层面

序列对齐60种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或者粘贴或上传您自己的序列。


超级家庭级别

浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合包括谷胱甘肽合成酶ATP-结合结构域样结构域。


   
超级家庭级别 家庭层面

检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


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