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冠状病毒(2020)

结构生物学在对抗冠状病毒SARS-CoV-2引起的当前新冠肺炎大流行中发挥着重要作用。本虚拟期刊介绍了IUCr期刊上发表的有关冠状病毒的文章和摘要。

许多结构生物学倡议正在进行中,以抗击新冠肺炎,这里仅举几个例子:由钻石光源研究人员领导的一项巨大碎片筛查活动(https://covid.postera.ai/covid网址); CASP倡议为SARS-2-CoV目标建模(http://predictioncenter.org/caspcommons/index.cgi); 新冠肺炎的原百科页面[http://proteopadia.org/w/Coronavirus_Disease_2019(英文)_(新冠肺炎)]; 通过具有众多链接的网页,在重新定义结构方面进行了大量合作(https://github.com/thorn-lab/冠状病毒_structural_task_force); 新冠肺炎门户网站,将汇集提交EMBL-EBI和其他主要生物医学数据中心的相关数据集(https://www.ebi.ac.uk/covid-19).

突出显示的插图

封面插图:这张扫描电子显微镜图像显示,SARS-CoV-2(黄色)病毒(导致新冠肺炎的病毒)是从美国一名患者身上分离出来的,从实验室培养的细胞表面(粉红色)出现。贷方:NIAID-RML

社论


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应用低温电子显微镜方法研究SARS-CoV-2蛋白,令人信服地证明了低温电子显微镜在结构生物学领域的威力。

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从最广泛的意义上讲,结晶学在应对当前新冠肺炎疫情方面发挥着至关重要的作用。关键病毒蛋白的结构信息大量涌现,重要的是,这些数据已立即与世界各地的研究人员共享,以加快有效治疗药物的发现。

研究论文


《水晶学报》。(2019).D类75,8-15
https://doi.org/10.1107/S2059798318014948

《水晶学报》。(2019).D类75,21-31
https://doi.org/10.107/S2059798318015322
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蝙蝠类干扰素刺激基因产物15(ISG15)的结构达维迪先生被阐明为1.37奥分辨率。来源于中国特有的一种长尾蝙蝠的ISG15与小鼠和人类的结构比较表明,ISG15的泛素样结构域之间存在一个保守的疏水界面。利用等温滴定量热法探讨了这种相互作用对木瓜蛋白酶样病毒脱ISGylase与ISG15结合的影响。

《水晶学报》。(2018).D类74,841-851
https://doi.org/10.107/S2059798318008318
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融合后的完整核心结构人冠状病毒229E穗蛋白测定值为1.86奥分辨率。比较不同冠状病毒中七肽重复序列HR1和HR2之间的相互作用揭示了一些差异,在设计靶向HR1的仿人冠状病毒HR2抑制剂时应考虑这些差异。

阿克塔·克里斯特。(2016年)。D类72,192-202
https://doi.org/10.107/S2059798315024328
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核衣壳N末端部分的结构特征中东呼吸综合征冠状病毒报道了一种新出现的病毒(MERS-CoV)。通过结合X射线衍射和SAXS,获得了N末端区域的结构,其中包括一个无序的尾部和一个球状畴。

《水晶学报》。(2015).F类71,977-980
https://doi.org/10.107/S2053230X15010146
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核衣壳蛋白N末端结构域的晶体中东呼吸综合征冠状病毒将X射线衍射到至少2.63的分辨率描述了。

《水晶学报》。(2015).F类71,1156-1160
https://doi.org/10.107/S2053230X15007359
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本文描述了非结构蛋白15的I26A/N52A突变体的初步晶体学数据人冠状病毒229E.

《水晶学报》。(2015).D类71,1102-1111
https://doi.org/10.107/S1399004715003521
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MERS-CoV 3CL公司赞成的意见已结晶,X射线晶体结构已被解析为三种不同的晶体形式,分别代表游离酶结构和酶-产物复合物。

《水晶学报》。(2014).F类70,1068-1071
https://doi.org/10.1107/S2053230X14012953
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本文描述了由人冠状病毒NL63主要蛋白酶及其抑制剂N3组成的复合物的初步晶体学数据。

《水晶学报》。(2014).D类70,572-581
https://doi.org/10.107/S1399004713031040
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类木瓜蛋白酶(PL)的晶体结构赞成的意见)泛素复合物中的C112S突变提供了对PL催化机制的分子基础的见解赞成的意见及其底物结合。N个-活性中心中的环己基-2-胺基甲磺酸分子提示了一种可能的抑制途径。

《水晶学报》。(2014).F类70,1620-1623
https://doi.org/10.107/S2053230X14023085
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本文描述了非结构蛋白9的功能突变体(N60K)的初步晶体学数据,该突变体来自人冠状病毒HKU1.

《水晶学报》。(2013).D类69,747-755
https://doi.org/10.1107/S907444913001315
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严重急性呼吸系统综合征冠状病毒M型二聚体R298A突变体的晶体结构赞成的意见深入了解M过程中控制单体-二聚体转化的分子机制赞成的意见成熟。

《水晶学报》。(2011).F类67,404-408
https://doi.org/10.107/S1744309111002867
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SARS冠状病毒nsp16 RNA-cap AdoMet依赖型(核苷2′)的表达、纯化和结晶O(运行))-报道了甲基转移酶与其激活因子nsp10的复合物。

《水晶学报》。(2011).F类67,790-793
https://doi.org/10.107/S1744309111017829
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克隆、过表达、纯化并结晶SARS冠状病毒非结构蛋白2的C末端结构域;晶体衍射到2.5奥分辨率。

《水晶学报》。(2010).F类66,815-818
https://doi.org/10.107/S1744309110017616
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获得了人冠状病毒OC43核衣壳蛋白N末端结构域的晶体,其X射线衍射分辨率至少为1.7Å.

《水晶学报》。(2010).F类66,706-708
https://doi.org/10.107/S174430911001417X
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编码禽传染性支气管炎病毒非结构蛋白9的基因片段已被克隆并表达于大肠杆菌蛋白质已经结晶,晶体将X射线衍射到2.44奥分辨率。

《水晶学报》。(2009).D类65,839-846
https://doi.org/10.107/S090744909018253

《水晶学报》。(2009).D类65,1292-1300
https://doi.org/10.107/S090744909040074

《水晶学报》。(2009).F类65,526-528
https://doi.org/10.107/S174430910901055
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编码人冠状病毒HKU1非结构蛋白9的基因被克隆并表达于大肠杆菌并对该蛋白进行结晶试验。

阿克塔·克里斯特。(2008).A类64,204-213
https://doi.org/10.107/S0108767307054426
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2003年爆发的严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒疫情对全球产生了深远的社会和经济影响。这篇综述强调了结构生物学的重要性,并表明在出现新的传染病时,可以快速确定药物设计的结构。

《水晶学报》。(2008).F类64,459-462
https://doi.org/10.107/S1744309108012396
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本文报道了SARS冠状病毒衍生肽VQQESSFVM与人类主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ类抗原HLA-B*1501结合的三维结构。

《水晶学报》。(2007).F类63,24-26
https://doi.org/10.107/S1744309106052341
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禽传染性支气管炎病毒主要蛋白酶已结晶;晶体衍射到2.7奥分辨率。

《水晶学报》。(2006).F类62,409-411
https://doi.org/10.107/S1744309106009407

《水晶学报》。(2006).F类62,405-408
https://doi.org/10.107/S1744309106009274

《水晶学报》。(2005).F类61,964-966
https://doi.org/10.107/S1744309105033257
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SARS冠状病毒主蛋白酶的正交晶型衍射分辨率为1.9报告了奥数。残基在催化位点的构象表明是一种活性酶。

《水晶学报》。(2004).D类60,2377-2379
https://doi.org/10.107/S090744904027258
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SARS-CoV尖峰蛋白融合核心的晶体生长于291K使用PEG 4000作为沉淀剂。晶体的衍射图样延伸至2.8分辨率为100K内部。晶体具有单位-细胞参数= 121.2,b条= 66.3,c(c)= 70.0λ,α=γ=90,β=107.4°,属于空间群C类2

《水晶学报》。(2004).D类60,2013-2015
https://doi.org/10.107/S090744904020517
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获得了小鼠冠状病毒-小鼠肝炎病毒刺突蛋白融合核心的初步晶体学数据。

《水晶学报》。(2003).D类59,1628-1631
https://doi.org/10.107/S090744903016779
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已开发出SARS-CoV全基因组方法,旨在确定其所有蛋白质或结构域的晶体结构。这里,克隆,大肠杆菌报道了SARS-CoV Nsp9蛋白的表达、纯化和结晶,这是第一个结晶的SARS-CoV蛋白。

相关摘要


《水晶学报》。(2014).A类70,1596年
https://doi.org/10.107/S2053273314084034

《水晶学报》。(2008年)。A类64,C327号
https://doi.org/10.107/S010876730808954X

《水晶学报》。(2008).A类64,C326号
https://doi.org/10.107/S0108767308089575

《水晶学报》。(2007年)。A类63,第287页
https://doi.org/10.107/S0108767307093518

《水晶学报》。(2007).A类63,第27页
https://doi.org/10.107/S0108767307099394

阿克塔·克里斯特。(2006).A类62,第177页
https://doi.org/10.107/S0108767306096462

阿克塔·克里斯特。(2005).A类61,50加元
https://doi.org/10.107/S0108767305097904

《水晶学报》。(2005).A类61,c236号
https://doi.org/10.107/S0108767305089944



《水晶学报》。(2005).A类61,c236号
https://doi.org/10.107/S0108767305089920

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