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.2015年9月25日;349(6255):aaa5612。
doi:10.1126/science.aaa5612。

DNA损伤反应通过抑制GATA4自噬诱导炎症和衰老

附属公司

DNA损伤反应通过抑制GATA4的自噬诱导炎症和衰老

Chanhee Kang(康昌熙)等。 科学类. .

摘要

细胞衰老是一个由p53和p16(INK4a)抑癌蛋白控制的末端应激激活程序。衰老的一个显著特征是衰老相关分泌表型(SASP),这是一种与肿瘤促进和衰老相关的促炎症反应。我们已经确定转录因子GATA4是衰老和SASP调节因子。GATA4在衰老细胞中稳定,是SASP所必需的。正常情况下,GATA4被p62介导的选择性自噬降解,但这种调节在衰老过程中受到抑制,从而稳定GATA4。GATA4反过来激活转录因子NF-κB启动SASP并促进衰老。GATA4的激活依赖于DNA损伤反应调节因子ATM和ATR,而不依赖于p53或p16(INK4a)。GATA4在包括衰老大脑在内的多个组织中积累,可能导致衰老及其相关炎症。

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数字

图1
图1。GATA4调节细胞衰老
(A类)左图:表达miR-146a GFP报告子的IMR90细胞感染了载体控制或表达GATA4的病毒,GFP荧光通过荧光激活细胞分选仪(FACS)(AFU,任意荧光单位)测量。数据显示为最大表达式的百分比(即每个箱子中的单元格数除以箱子中包含最大单元格数的单元格数),以便进行规范化。右:计算中值荧光强度(MFI)并将其归一化为矢量控制。数据为平均值±SEM(B类)左图:表达miR-146a-GFP报告子并转染指示siRNAs的IMR90细胞暴露于IR(12Gy)下,用FACS测定GFP荧光;cont表示萤火虫荧光素酶siRNA控制。中心:计算MFI并将其归一化以控制siRNA(−IR);数据为平均值±SEM。右:免疫印迹分析显示GATA4缺失的效率。(C类)携带Dox-诱导型(Tet-On)载体表达GATA4(Tet-GATA4)或空载体(Tet-vector)的BJ细胞在有或无Dox的情况下生长,并分析SA-β-Gal染色(左)和BrdU掺入(右)。数据为平均值±SEM(D类)携带以萤火虫荧光素酶为靶点的对照shRNA载体或GATA4 shRNA载体的BJ细胞暴露于IR(8 Gy),7天后进行免疫印迹分析(左)和SA-β-Gal染色(右)。数据为平均值±SEM;统计分析采用单因素方差分析(ANOVA)。(E类)通过表达对照或GATA4 shRNAs的BJ细胞的细胞生长分析来评估复制衰老。左:群体加倍分析右:SA-β-Gal染色定量。数据为平均值±SEM;采用单因素方差分析进行统计分析。数据代表四个(A)或三个[(B)至(E)]独立实验。
图2
图2。选择性自噬以p62依赖的方式降解GATA4以防止衰老
(A类)Western blot显示IR诱导衰老期间GATA4蛋白的丰度(top),癌基因(RAS)V12版本)–诱导衰老(左中)或复制衰老(右中);底部显示了IR诱导衰老过程中GATA4 mRNA的丰度。PD表示人口翻倍。GATA4 mRNA的相对丰度表示为未经IR处理的细胞中表达的变化。(B类)在存在环己酰亚胺(CHX)的情况下,检测增殖细胞(−IR)或IR诱导的衰老细胞[+IR,暴露于IR(12 Gy)后7天]中GATA4蛋白的稳定性。所示为代表性免疫印迹(顶部)和三个独立实验的定量(底部)。数据为平均值±SEM(C类)用蛋白酶体抑制剂MG-132处理IMR90细胞指定时间,并通过Western blotting分析蛋白质。p21作为MG-132的阳性对照。(D类)用指示的自噬抑制剂处理IMR90细胞指定的时间,并用指示的抗体通过免疫印迹分析蛋白质。所示为代表性免疫印迹(左)和四个独立实验的定量(右,24小时治疗)。数据为平均值±SEM;采用单因素方差分析进行统计分析。(E类F类)用指示的siRNA转染IMR90细胞,转染79小时后通过Western blotting分析蛋白质;cont表示萤火虫荧光素酶siRNA(G公司)来自增殖(−IR)或IR诱导的衰老IMR90细胞的Flag-GATA4免疫沉淀物的免疫印迹[+IR,暴露于IR(12 Gy)后7天]。IR后6天,用二甲基亚砜(DMSO)或Baf A1处理细胞24小时,然后取样以阻止GATA4和p62降解。(H(H))用Dox处理表达所示Dox诱导的shRNAs的IMR90细胞,并进行SA-β-Gal染色(−Dox,Dox停用16天;+Dox,Domx停用16天后;清洗,Dox启用12天,Dox禁用4天);cont表示以萤火虫荧光素酶为靶点的对照shRNA。()携带表达ATG7 shRNA和对照shRNA或GATA4 shRNA的Dox诱导载体的IMR90细胞用Dox处理,并进行免疫印迹分析(顶部)、SA-β-Gal染色(中部)和BrdU掺入(底部)。标签如(H)所示;数据为平均值±SEM。采用双向方差分析进行统计分析。数据代表三个[(A)、(B)、(E)]、四个(D)或两个[(C)、(F)、(G)、(H)、(I)]独立实验。
图3
图3。基因表达谱分析显示GATA4控制SASP
(A类)左图:来自携带表达GATA4的Dox诱导型载体的IMR90细胞的mRNA表达谱鉴定了显著上调的基因(绿色、对照的表达超过200%,<0.05)或下调(红色,低于50%的对照表达,<0.05)。右:上调(绿色)或下调(红色)基因的GO术语分析。数据来自三个独立的实验。(B类)GATA4调节基因(GATA4调控集)和复制衰老调节基因(衰老集)之间的重叠,用于表达超过200%或低于50%的对照基因。χ2检验用于统计分析。(C类)携带表达GATA4的Dox诱导载体或空载体对照的IMR90细胞未经治疗或使用Dox治疗2天,并通过RT-qPCR对所示基因的mRNA丰度进行量化。所示mRNA的相对丰度表示为在无Dox治疗的空载体控制细胞中表达的变化。(D类)将转染有所示siRNAs的IMR90细胞暴露于IR(12Gy)下并培养7天。mRNA的丰度如(C)所示。所示mRNA的相对丰度表示为未经IR处理的对照siRNA转染细胞的表达变化。数据代表四个(C)或三个(D)独立实验。
图4
图4。GATA4调节NF-κB
(A类)将所示的siRNA转染IMR90细胞;转染后2天,细胞未经处理或用Dox处理2天以诱导GATA4。mRNA丰度用qPCR定量。所示mRNA的相对丰度表示为未经GATA4诱导转染对照siRNA的细胞中表达的变化。(B类)表达GATA4的IMR90细胞中核NF-κB/RELA积聚(左)或免疫印迹(中)的免疫细胞化学。免疫印迹分析(右)在IR-诱导衰老期间对转染有指示siRNAs的IMR90细胞进行。(C类)用Dox处理表达GATA4的IMR90细胞2天,并用RT-qPCR定量所示基因的mRNA丰度。所指示的mRNA的相对丰度表示为相对于未经Dox处理的细胞中的表达的变化。插图:TRAF3IP2的免疫印迹分析。(D类)将所示的siRNA转染IMR90细胞;1天后,诱导2天GATA4,并分析指示蛋白(左)或mRNA(右)的丰度。所示mRNA的相对丰度表示为未经GATA4诱导转染对照siRNA的细胞中表达的变化。(E类)在暴露于IR(12 Gy)后的第1天,用所示的siRNA转染IMR90细胞。转染三天后,用Dox诱导由TRE启动子驱动的TRAF3IP2 5天。在TRAF3IP2诱导1天后,用指示的siRNAs再次感染细胞,以加强细胞耗竭。使用RT-qPCR分析mRNA的丰度,显示的mRNA的相对丰度表示为与未经IR和TRAF3IP2诱导的对照siRNA转染细胞的表达变化有关;cont指萤火虫荧光素酶siRNA控制。(F类)转染指示的siRNAs一天后,诱导GATA4 3.5天,并对细胞进行SA-β-Gal染色定量。采用双向方差分析进行统计分析。数据代表三个[(A)、(B)、(D)、(F)]或两个[(C)、(E)]独立实验。
图5
图5。GATA4通路的功能独立于p53和p16通路,并受DDR激酶ATM和ATR的调节
(A类)表达对照或p53 shRNAs的BJ细胞用Dox处理4天,以诱导TRE启动子驱动的GATA4。免疫印迹分析(左)和SA-β-Gal染色(右)。数据为平均值±SEM;cont指靶向萤火虫荧光素酶的对照shRNA。(B类)表达HPV E6或E6和E7的BJ细胞用Dox处理3.5天,诱导由Tet启动子驱动的GATA4,并进行SA-β-Gal染色。数据为平均值±SEM(C类)在表达HPV E6或E6和E7的对照(−IR)或IR处理的[+IR,暴露于IR(12 Gy)后7天]细胞中检测GATA4蛋白的丰度。(D类)顶部:用10 mM nutlin-3处理BJ和IMR90细胞7天。每2天刷新一次媒体。底部:由TRE启动子驱动的p16被诱导4或7天。每2天刷新一次媒体。通过Western blotting分析指示蛋白的丰度。(E类)IMR90细胞用10mM坚果蛋白-3预处理7天,并在暴露于IR(12Gy)之前洗去坚果蛋白-3。IR后7天通过Western blotting分析指示蛋白的丰度(F类)IMR90细胞在暴露于IR(12 Gy)之前,用咖啡因(ATM和ATR抑制剂,1 mM)(左)或ATM抑制剂(ku55933,10 mM)、ATR抑制剂(VE-821,10 mM)或两者(右)预处理1小时。每2天刷新一次培养基,共7天,并通过Western blotting分析指示蛋白的丰度。数据代表三个[(A)、(E)、(F)]或两个[(B)、(C)、(D)]独立实验。(G公司)GATA4如何将自噬和DDR与SASP和细胞衰老联系起来的模型。详见正文。
图6
图6。GATA4在小鼠衰老、人类衰老和小鼠IR诱导的衰老过程中积累
(A类)将小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)暴露于IR(12Gy),并对GATA4蛋白进行蛋白质印迹(左)和免疫荧光(中)。表达对照或GATA4 shRNA的MEF细胞暴露于IR(12Gy);7天后,通过RT-qPCR(右)量化所示基因的mRNA丰度。所示mRNA的相对丰度表示为未经IR处理的细胞中表达的变化。数据代表了两个独立的实验。(B类)左:在7 Gy]C57BL/6小鼠全身照射(TBI)3个月后,从对照组(−IR)和经IR处理的[+IR)收集肝脏和皮肤组织,并通过Western blotting进行分析。右:进行密度分析以确定GATA4/GAPDH比率。数据为平均值±SEM(C类)左:取年轻(6月龄)和老年(22月龄)C57BL/6小鼠的肝组织,进行Western blotting分析。右:密度分析,如(B)所示。数据为平均值±SEM(D类)左图:通过Western blotting分析年轻和老年人前额叶皮层提取物中GATA4蛋白的丰度。给出了每个样本的年龄和性别(F=女性,M=男性)。右:密度分析,如(B)所示。数据为平均值±SEM。在(B)至(D)中,每条车道代表一种情况。(E类)左:典型青年和老年患者前额皮质GATA4(红色)、p16(绿色)、GFAP(白色)和DNA(DAPI,蓝色)的共焦免疫荧光标记。右上角:少突胶质细胞的免疫荧光定量分析(年轻,n个= 8; 老年人,n个=8),锥体神经元(年轻,n个= 8; 老年人,n个=8)和星形胶质细胞(年轻,n个= 5; 老年人,n个= 6). AFU值显示为平均值±SEM。右下:GATA4和p16蛋白丰度的相关分析。每个点代表一个单独的细胞(少突胶质细胞,n个= 633; 锥体神经元,n个= 505; 星形胶质细胞,n个= 411). 斯皮尔曼相关系数(R(右))和P(P)显示了老年人细胞的价值。

中的注释

  • 细胞生物学。GATA控制衰老。
    Cassidy LD,成田M。 Cassidy LD等人。 科学。2015年9月25日;349(6255):1448-9. doi:10.1126/science.aad2501。 科学。2015 PMID:26404812 没有可用的摘要。
  • 衰老调控的新途径。
    曹十、李明。 曹X等。 基因组蛋白质组学生物信息学。2015年12月;13(6):333-5。doi:10.1016/j.gpb.2015.11.002。Epub 2016年1月8日。 基因组蛋白质组学生物信息学。2015 PMID:26777575 免费PMC文章。 没有可用的摘要。

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