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比较研究
.2004年1月;83(1):130-9.
doi:10.1016/s0888-7543(03)00214-3。

真核生物TDP基因家族的结构多样性及其功能意义

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比较研究

真核生物TDP基因家族的结构多样性及其功能意义

Hung-Yi Wang(王洪一)等。 基因组学. 2004年1月.

摘要

TDP-43是一种RNA结合蛋白,在哺乳动物细胞中起转录抑制和外显子跳跃的作用。编码TDP-43(HGMW-approved gene symbol TARDBP)的基因在人类、小鼠、果蝇和秀丽隐杆线虫中保守。四个分类群中TDP基因编码区的序列比较显示,序列分化率极低,表明TDP基因在这些生物体中发挥着重要的功能。通过DNA转染实验,我们确定了富含甘氨酸的结构域对TDP-43外显子kipping活性的重要性。人类和小鼠的TDP基因都属于一个基因家族,该家族也由许多加工假基因组成。有趣的是,结合数据库分析和cDNA克隆已经证明哺乳动物TDP基因的初级转录物经过选择性剪接产生11个mRNA,包括编码TDP-43的mRNA。11个剪接事件中的8个涉及到使用4个5’-供体和3’-受体位点,所有这些位点都位于TDP-43 mRNA的最后一个外显子内。TDP编码蛋白的多剪接异构体的存在进一步支持了真核生物TDP基因的功能复杂性。

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