新冠肺炎大流行已引起人们对与SARS-CoV-2进入相关的人类宿主基因以及调控这些基因表达的因素的关注。在NCBI,我们优先考虑了对这些基因在RefSeq功能元素项目。 我们的注释包括一些增强子、启动子、顺调控元件和蛋白质结合位点等特征类型。 在最新的人类注释发布中,我们注释了27个不同生物区域的236个调控特征(109.20200522)包括ABO公司, ACE2公司,ANPEP公司, CD209型, CLEC4G公司, CLEC4M系列, CTSL公司,DPP4(DPP4)、和TMPRSS2型 基因.
您可以使用我们的新轨道枢纽我们最近宣布。您还可以看到生物区域和特征轨迹。这些都有功能性和描述性元数据,包括生物区域摘要、实验证据类型、出版物支持等。
图1中的例子显示了NCBI的基因组数据查看器(GDV)中ABO基因区域(GRCh38,NW_009646201.1:73864-103789)人类ABO血型的测定者。最近一项全基因组关联研究发现,非编码ABO变异与新型冠状病毒肺炎严重程度相关(PMID:32558485),映射到此区域中的某些RefSeq功能元素。图1。人类ABO基因区在NCBI GDV中显示RefSeq功能元素功能。生物区域聚集轨迹显示ABO上游增强子的潜在特征注释(LOC112637023号),启动子区(LOC112679202号),+5.8内含子1增强子(LOC112679198号),3′调控区(LOC112639999号)和a+36.0下游增强子(LOC112637025号).功能元件特征包括许多增强子、启动子、顺调控元件和蛋白质/转录因子结合位点。
我们在网站,包括数据下载和提取选项。请继续关注NCBI见解以及其他NCBI社交媒体,以便将来发布RefSeq Functional Elements!