光生物学

程序包'光生物学'定义用于存储的类系统光谱数据和伴随的元数据。对于每个类提供了专门的总结方法、数学运算符和函数。此外，用于存储类的对象集合的类对于单个光谱，定义了“应用”函数。实现了提取和替换运算符。

计算太阳位置、日出时间的功能日落、日照和夜照也得到了实施。

该软件包支持辐射数据的存储和操作物体和溶质的光学性质，以及光生物、光化学和光电响应。

该软件包是一套光生物学R软件包的核心计算说明见r4光生物学网站和中的渐晕光生物学的R一套.

示例

第一个示例向您展示了如何以W/m2为单位估计太阳辐照度在过滤器下。我们使用测量的太阳光谱和测量的滤光片传输频谱。

图书馆(光生物学)伊拉德(日照spct * 黄gel.spct)#>E_总计
#> 146.506
#>attr（，“time.unit”）
#>[1]“秒”
#>attr（，“辐射单位”）
#>[1]“总能量辐照度”

第二个示例显示了一些简单的天文计算太阳。

地理编码 <- 数据帧(离子 = 0,纬度 = 55)日期 <- 杂交的::现在(tzone公司 = "联合技术公司")日出时间(日期,tz（赫兹） = "联合技术公司",地理编码 = 地理编码)#>[1]“2023-01-06 08:23:01 UTC”日长度（_L）(日期,tz（赫兹） = "联合技术公司",地理编码 = 地理编码)#> [1] 7.423294

安装

CRAN最新稳定版本的安装：

安装.包("光生物学")

安装“光生物学”软件包后，安装剩余的或CRAN套件中丢失的包裹：

内置包装 <-已安装.packages（）[，1]缺少_千克 <-设置差异(光生物学::r4p_包装,内置包装)如果（长度(缺少_千克)> 0) {安装.包(缺少_千克)}

从GitHub安装当前不稳定版本：

#install.packages（“devtools”）
开发工具::安装github("无晶状体/光生物学")

文档

HTML文档位于(https://docs.r4photobiology.info/photobiology网站/)，包括三个用户指南.

关于“r4photobiology”套件不同软件包更新的新闻定期发布在(https://www.r4photobiology.info/).

两篇文章介绍了套房设计背后的基本思想并描述其用途：Aphalo P.J.（2015）(https://doi.org/10.19232/uv4pb.2015.1.14)和Aphalo P.J.（2016）(https://doi.org/10.19232/uv4pb.2016.1.15).

一本书正在编写中，草稿目前可以在(https://leanpub.com/r4光生物学/).

在开发套件之前编写的手册包含有用的紫外线定量和操作信息可见辐射：Aphalo，P.J.，Albert，A.，Björn，L.O.，McLeod，A。R.、Robson，T.M.和Rosenqvist，E.（编辑）（2012）《超越可见：A》植物紫外线光生物学最佳实践手册（第1版，第xxx页+174). 赫尔辛基：赫尔辛基大学生物科学系，植物生物学部。ISBN 978-952-10-8363-1（PDF），978-952-10-8362-4（平装本）。PDF文件可从(https://hdl.handle.net/10138/37558).

贡献

欢迎访问Pull请求、错误报告和功能请求(https://github.com/aphalo/光生物学).

引用

如果您使用此软件包生产科学或商业产品出版物，请根据以下内容引用：

引用("光生物学")#>
#>要在出版物中引用“光生物学”包，请使用：
#>
#>Aphalo，Pedro J.（2015）《r4光生物学套件》。UV4植物公告，
#>   2015:1, 21-29. DOI:10.19232/uv4pb.2015.1.14
#>
#>LaTeX用户的BibTeX条目是
#>
#>@文章{，
#>作者={佩德罗·J·阿帕哈洛}，
#>title={r4光生物学套件}，
#>期刊={UV4Plants Bulletin}，
#>数量={2015年}，
#>数字={1}，
#>页数={21-29}，
#>年份={2015年}，
#>doi={10.19232/uv4pb.2015.114}，
#>   }

许可证

©2012-2023 Pedro J.Aphalo版权所有(pedro.aphalo@helsinki.fi). 发布日期：GPL版本2或更高版本。此软件不提供任何种类。