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米萨++

swMATH ID: 32577
软件作者: 鲁曼·格斯特;安娜·梅迪尤基纳(Anna Medyukhina);马克·蒂洛·菲格
描述: MISA++:自动化生物图像分析的标准化界面。现代成像技术,如光片荧光显微镜(LSFM),可以在三维空间中捕捉整个器官。对这些大容量图像数据的分析需要结合用户友好和高效的工具。我们在此介绍MISA++,这是一个图像分析框架,它允许通过标准化组件将定制的高性能C++工具轻松集成到第三方应用程序中,用于并行化、数据和参数处理、命令行界面以及与第三方应用程序的通信。我们通过为ImageJ实现一个插件来展示其功能,该插件为使用我们的框架构建的任何应用程序提供了图形用户界面,并对基于Python的算法进行了高性能的重新实现,以在整个小鼠肾脏的LSFM图像中分割肾小球
主页: https://applied-systems-biology.github.io/misa-framework网站/
源代码:  https://github.com/applied-systems-biology/misa-framework网站
关键词: 图像处理;并行化;应用程序集成;薄片荧光显微镜;大容量图像数据;软件X;生物图像分析
相关软件: 图像库2;scikit-图像;蛇制造;CLIJ公司;细胞档案器;伊拉斯提克;KNIME公司;冰冷的;图像J2;卤化物;ITK公司;打开CV
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标准条款

1出版物描述软件 年份
MISA++:自动化生物图像分析的标准化接口链接
鲁曼·格斯特;安娜·梅迪尤基纳(Anna Medyukhina);马克·蒂洛·菲格
2020