PG工具 swMATH ID: 31812 软件作者： Nagaraj，S.H。；Waddell，N。；Madugundu，A.K。；木材，S。；Jones，A。；Mandyam，R.A。；Nones，K。；Pearson，J.V。；S.M.格里蒙德。 描述： PGTools：蛋白质组数据分析和可视化软件套件。我们描述了PGTools，一个用于蛋白质组数据分析和可视化的开源软件套件。PGTools包括应用程序、库、定制数据库和可视化工具，用于使用蛋白质组学和基因组学背景组合分析质谱数据。一个命令就足以搜索数据库，计算错误发现率，对蛋白质进行分组和注释，从RNA-Seq转录物生成肽数据库，识别与癌症相关的改变蛋白质，并使用复杂的可视化工具可视化基因组级肽数据集。我们通过实验证实了人类PANC-1细胞中的蛋白质基因组肽子集，并利用结直肠癌数据集证明了PGTools的实用性，该数据集导致识别了203个传统蛋白质组学方法遗漏的新蛋白质编码区。PGTools应同样适用于个体蛋白基因组研究以及以染色体为中心的人类蛋白质组项目（C-HPP）等国际倡议。PGTools位于http://qcmg.org/bioinformatics/PGTools。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25760677 相关软件： GeneScout公司;iPiG公司;KNIME公司;MyriMatch公司;佩皮;PGx公司;ProteoAnnotator（蛋白质注释器）;串联;PGMiner公司 引用于： 0个文档