GeneScout公司 swMATH ID: 31815 软件作者： 尹，Michael M。；Jason T.L，王 描述： GeneScout：用于预测基因组DNA序列中脊椎动物基因的数据挖掘系统。基因组DNA中编码序列的自动检测或预测是脊椎动物基因研究中的一个重要的速率控制步骤。目前可用的程序远远不够强大，无法完全阐明基因结构。本文中，我们提出了一个新的系统，称为GeneScout，用于预测脊椎动物基因组DNA中的基因结构。该系统包含专门设计的隐马尔可夫模型（HMM），用于检测功能位点，包括蛋白质翻译起始位点、mRNA剪接连接供体和受体位点等。还提出了HMM模型用于外显子编码电位计算。我们的主要假设是，给定脊椎动物基因组DNA序列S，总是有可能构造一个有向无环图G，使得S的实际编码区域的路径位于G上所有路径的集合中。因此，基因检测问题简化为分析图G中的路径。使用动态规划算法在G中寻找最优路径。使用期望最大化算法对所提出的系统进行训练，并使用10路交叉验证方法评估其在脊椎动物基因预测方面的性能。实验结果表明，该系统性能良好，与现有的基因发现工具相当。 主页： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0020025503004225 相关软件： iPiG公司；KNIME公司；MyriMatch公司；佩皮；PG工具；PGx公司；ProteoAnnotator（蛋白质注释器）；串联；PGMiner公司；维西姆；岩石；COOLCAT公司；群集查找；UCI-毫升 引用于： 3文件 4位作者引用 三 钟盛 1 陈婷婷 1 迪维希·沙阿 1 杨志强 连载1篇 三 信息科学 在2个字段中引用 三 计算机科学（68至XX） 三 信息与通信理论、电路（94-XX） 按年份列出的引文