MyriMatch公司 swMATH ID: 31817 软件作者： Tabb，D.L。；费尔南多，C.G。；钱伯斯，M.C。 说明： MyriMatch：通过多元超几何分析进行高精度串联质谱肽鉴定。Shotgun蛋白质组学实验依赖数据库搜索引擎从串联质谱中识别肽。许多算法通过评估每个肽序列和观察到的光谱之间匹配的片段离子数来评估潜在的识别。然而，这些系统通常不区分匹配强峰和匹配小峰。我们开发了一个基于多元超几何分布的统计模型来对肽匹配进行评分。这个记分器是“MyriMatch”数据库搜索引擎的一部分，它更加强调匹配密集的峰值。可以利用每个频谱的最佳匹配以随机概率发生的概率来区分正确匹配和随机匹配。我们在使用三种不同离子阱仪器的三个不同实验室的数据集上评估了该软件。采用一种新的系统来测试区分能力，我们证明将峰值分层到多个强度等级可以提高评分的区分能力。我们将MyriMatch结果与Sequest和X！串联，表明它比这两种算法都具有更高的识别能力。当使用最小峰值滤波时，对于不按强度分层匹配峰值的评分模型，性能会急剧下降。另一方面，我们发现，随着每个光谱中保留更多的峰，MyriMatch辨别能力会提高。MyriMatch还可以很好地缩放高分辨率质谱分析仪的串联质谱。这些发现可能表明了现有数据库搜索记分器的局限性，这些记分器只计算匹配的峰值，而不按强度进行区分。此软件和源代码在Mozilla公共许可证下提供，网址为：http://www.mc.vanderbilt.edu/msrc/bioinformatics/。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2525619/ 相关软件： 串联;GeneScout公司;iPiG公司;KNIME公司;佩皮;PG工具;PGx公司;ProteoAnnotator（蛋白质注释器）;PGMiner公司;戴维 引用于： 2文件 全部的 前5名6位作者引用 1 苏西米塔·达塔 1 瑞安·吉尔。 1 米特拉、里滕 1 礼萨州莫达雷斯 1 辛吉尼·锡达尔 1 宋宇 2篇连载文章中引用 1 统计 1 应用统计学杂志 在2个字段中引用 2 统计学（62-XX） 1 概率论与随机过程（60-XX） 按年份列出的引文