PDB-重新设计 swMATH ID: 26865 软件作者: Noguchi,T。;Y.秋山。 描述: PDB-REPDB是来自蛋白质数据库(PDB)的代表性蛋白质链数据库。1997年8月,它开始于真实世界计算伙伴关系(RWCP),发展成为目前的PDB-REPRDB系统。2001年4月,该系统被转移到国家先进工业科学技术研究院计算生物学研究中心(http://www.cbrc.jp/); 它在http://www.cbrc.jp/pdbreprdb/。目前的数据库包括16 682个PDB条目(2002年9月1日)中的33 368条蛋白质链,其中不包括(a)DNA和RNA数据,(b)理论建模数据,(c)短链(1<40个残基),或(d)所有残基具有非标准氨基酸残基的数据。由于改进了X射线结晶学、核磁共振和电子显微镜实验技术,随着膜蛋白结构数量的测定,PDB中包括膜蛋白结构在内的条目数量迅速增加。由于许多蛋白质结构研究必须分别处理球状蛋白和膜蛋白,PDB-REPRDB系统中引入了这种新的消除因子,它不包括膜蛋白链。此外,膜蛋白链的PDB-REPDB系统从相同的URL开始。当前的膜数据库包括551条蛋白链,包括1.59版SCOP数据库中的膜域(2002年5月15日)。 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC165469/ 相关软件: 促销;建模师;供应商管理部;对;爆炸;磅/平方英寸(磅/平方英寸);BioHEL公司;PROFcon公司;4.5条 引用于: 1文件 3位作者引用 1 克里斯蒂娜·本罗斯 1 亚历山大·G·德布雷文。 1 谢尔盖·哈佐特 连载1篇 1 理论生物学杂志 在2个字段中引用 1 计算机科学(68至XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文