防喷器

GAPED BLAST和PSI-BLAST:新一代蛋白质数据库搜索程序。BLAST程序是广泛用于搜索蛋白质和DNA数据库以寻找序列相似性的工具。对于蛋白质比较,这里描述的各种定义、算法和统计改进允许BLAST程序的执行时间大大减少,同时提高它们对弱相似性的敏感性。一个新的触发单词命中扩展的标准,结合一个新的启发式生成间隙对齐,生成一个间隔BLAST程序,其运行速度大约是原始程序的三倍。此外,还介绍了一种将BLAST产生的统计显著性对齐自动组合到一个位置特定得分矩阵中,并使用该矩阵搜索数据库的方法。由此产生的位置特定迭代BLAST(PSIBLAST)程序每次迭代的运行速度与间隙BLAST大致相同,但在许多情况下,对较弱但与生物学相关的序列相似性更为敏感。PSI-BLAST被用来发现BRCT超家族中一些新的有趣的成员。


zbMATH参考文献(217篇文章引用)

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  1. Ahmad,Jamal;Hayat,Maqsood:MFSC:采用Chou's PseAAC成分的一般形式对高尔基蛋白进行分类的基于多投票的特征选择(2019年)
  2. 兰迪奇,米兰:数理化学插图:对鲜为人知的结果的个人看法(2019)
  3. Rout,Subhashree;Mahapatra,Rajani Kanta:\textITi恶性疟原虫CDPK5蛋白的分子建模、对接和动力学分析(2019年)
  4. 基因组学预测方法:单基因预测;刘小安,单基因;刘小安;刘四安;基因组学方法
  5. 王磊;闫,欣;刘梦林;宋克坚;孙晓飞;潘文文:结合特征选择集成方法的深度卷积神经网络预测RNA蛋白质相互作用(2019)
  6. Kinjo,Akira R.:序列空间中的合作“折叠转换”促进了蛋白质家族的功能驱动进化(2018)
  7. 梁云云;张胜利:通过Kullback-Leibler Difference将不同模式的PSSM整合到周氏通用PseAAC中,识别革兰氏阴性细菌分泌的蛋白质类型(2018)
  8. 田坤;赵新新;邱士泰:生物类群进化和系统发育关系的凸壳分析(2018)
  9. 张胜利;梁云云:结合自相关和PSSM预测凋亡蛋白亚细胞定位(2018)
  10. Abboud,Amir;Backurs,Arturs:多项式时间问题的逼近硬度(2017)
  11. Dezhangi,Abdollah;López,Yosvany;Lal,Sunil Pranit;Taherzadeh,Ghazaleh;Michaelson,Jacob;Sattar,Abdul;Tsunoda,Tatsuhiko;Sharma,Alok:PSSM Suc:使用位置特定的评分矩阵精确预测琥珀酰化,并将其应用到bigram中进行特征提取(2017)
  12. 基思,乔纳森M.(编辑):生物信息学。第二卷:结构、功能和应用(2017)
  13. Pai,Priyadarshini P.;Dash,Tirtharaj;Mondal,Sukanta:使用概率方法对蛋白质RNA相互作用残基的序列识别(2017年)
  14. Shatabda,Swakkhar;Saha,Sanjay;Sharma,Alok;Dezhangi,Abdollah:使用进化和结构特征识别噬菌体蛋白位置(2017年)
  15. 焦亚森;杜步峰:利用周氏伪氨基酸组成的一般形式预测高尔基体驻留蛋白类型:最小冗余最大相关特征选择方法(2016)
  16. 焦亚森;杜步峰:利用伪氨基酸组成预测高尔基体驻留蛋白质类型:基于位置特异性物理化学性质的方法(2016)
  17. 梁云云;刘三阳;张胜利:去趋势相关系数:预测凋亡蛋白亚细胞定位的应用(2016)
  18. 李玉双;刘谦;郑晓琪:DUC曲线,DNA序列的高度紧凑二维图形表示及其在序列比对中的应用(2016)
  19. Axelson Fisk,Marina:比较基因发现。模型、算法和实现(2015)
  20. Kotsifakos,Alexios;Stefan,Alexandra;Athitsos,Vassilis;Das,Gautam;Papapetrou,Panagiotis:DRESS:降维高效序列搜索(2015)

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