PS-BLAST

GAP-BLAST和PSI-BLAST:新一代蛋白质数据库搜索程序。BLAST程序是广泛用于搜索蛋白质和DNA序列相似性的工具。对于蛋白质比较,这里描述的各种定义、算法和统计细化允许BLAST程序的执行时间基本上减少,同时增强它们对弱相似性的敏感性。一个新的触发字点击扩展的标准,结合一个新的用于产生间隙对齐的启发式算法,产生了一个以原始速度的大约三倍运行的空隙BLAST程序。此外,引入了一种方法,用于将由爆炸产生的统计显著比对自动组合成特定位置的得分矩阵,并使用该矩阵搜索数据库。所产生的位置特定迭代爆炸(PSSIBLAST)程序以近似的速度运行,每一次迭代作为抽空爆炸,但在许多情况下,对弱但生物相关的序列相似性更敏感。PSI-BLAST用于揭示BRCT超家族的几个新的和有趣的成员。


ZBMaCT中的参考文献(213篇文章中引用)

显示结果1至20的213。
按年份排序(引文
  1. 艾哈迈德,贾马尔;HayAT,MqSOOD:MFSC:基于Couth-PaSac分量的一般形式的高尔基蛋白质分类的多投票特征选择(2019)
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  3. Mahapatra,Rajani Kanta:通过分子模拟、对接和动力学对恶性疟原虫CDPK5蛋白的文本分析(2019)
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  7. 梁,Yunyun;张,胜利:通过Kullback-Leibler散度(2018)将不同的PSM模式结合到Chou的一般PASAAC中,鉴定革兰氏阴性细菌分泌蛋白类型。
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  11. 基思,Jonathan M.(ED):生物信息学。第二卷:结构、功能和应用(2017)
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  15. 焦,Ya Sen;杜,Pu Feng:用假性氨基酸组成预测高尔基常驻蛋白质类型:具有位置特异性理化性质的方法(2016)
  16. 梁,Yunyun;刘,Sanyang;张,胜利:去趋势互相关系数:预测细胞凋亡蛋白亚细胞定位的应用(2016)
  17. Axelson Fisk,玛丽娜:比较基因发现。模型、算法与实现(2015)
  18. 科西法科斯,阿列克西奥斯;斯特凡,亚历山德拉;阿西托斯,瓦西里斯;达斯,高塔;Papapetrou,帕纳吉奥蒂斯:服饰:高效序列搜索的降维(2015)
  19. 刘,Taigang;陶,培英;李,肖伟;秦,Yufang;王,淳化:基于PSM和递归特征消除的三元编码的凋亡蛋白亚细胞定位预测(2015)
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