百万

一个以生物学家为中心的DNA和蛋白质序列进化分析软件。分子进化遗传学分析(MEGA)软件是一个桌面应用程序,用于比较分析来自多基因家族或不同物种的同源基因序列,特别强调推断DNA和蛋白质进化的进化关系和模式。除了用于数据统计分析的工具外,MEGA还为从文件或基于web的存储库中组装序列数据集提供了许多方便的工具,它还包括以交互式系统进化树和进化距离矩阵的形式可视化显示结果的工具。在这里,我们将讨论影响MEGA发展的动机、设计原则和优先事项。我们还讨论了MEGA在未来如何发展,以帮助研究人员不断增长的使用新的计算方法分析大数据集的需求。


zbMATH中的参考文献(参考文献35条)

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按年份排序(引用)
  1. 科琳,莉娜;Gavryushkin,Alex:计算排序系统树之间的最近邻交换距离(2021)
  2. 古洛托,丹尼洛:蛋白质宇宙中进化关系的微调探索(2021)
  3. 奥斯塔什、博丹;Maria Anisimova:基因组内部和跨基因组密码子使用的可视化:概念和工具(2020)
  4. 路特,亚灰树;Mahapatra,Rajani Kanta:\textITi恶性疟原虫CDPK5蛋白的分子建模、对接和动力学分析(2019年)
  5. 沃诺,坦迪(编辑):生物信息学和系统发育学。伯纳德·莫雷特的开创性贡献(2019)
  6. 吴承元;任世权;吴洁;Xia,Kelin:基因组序列的Magnus表示法(2019)
  7. 刘勇;陈静安;钱,洁英;林浩;孙宁;Huang,Zunnan:琼脂林形成过程中的\textquilariasinensis倍半萜合酶的进化分析和结构特征:一项计算研究(2018)
  8. 戴维森,露丝;鲁辛科,约瑟夫;弗农,佐伊;Xi,Jing:欧几里德空间中距离数据分布的建模(2017)
  9. 德雷利希,伊丽莎白;盖纳·杜瓦,安德鲁;哈灵顿,希瑟A。;何其俊;海奇,克里斯汀;Poznanović,Svetlana:几何组合学和计算分子生物学:RNA序列的分支多面体(2017)
  10. Erciyes,K.:生物信息学的分布式和序列算法(2015)
  11. 罗伊乔杜里,阿林达;威利斯,艾米;Bunge,John:系统发育树最大似然估计量的一致性(2015)
  12. 波德,阿维吉特;尼迪,贾塔纳;Latha,N.:人类多巴胺受体相互作用网络(DRIN):网络拓扑、稳定性和功能的系统生物学观点(2014)
  13. 阴、长川;陈颖;Yau,Stephen S.-T.:基于傅立叶变换的DNA序列相似性度量及其在层次聚类中的应用(2014)
  14. 于成龙;何露西,荣;Yau,Stephen S.-T.:基于Lempel-Ziv复杂性和Hausdorff距离的病毒基因组系统发育(2014)
  15. de Farias,Sávio Torres:基于祖先序列构建的tRNAs系统发育学建议(2013)
  16. 杨锡武;王天明:短(k)线性回归模型-词:适用于不同长度生物序列的相似距离(2013)
  17. 南布迪里,萨里萨;朱利安尼,亚历山德罗;奈尔,阿丘特桑卡尔。;Dhar,Pawan K.:寻找基于序列的变构定义:不同分辨率尺度下的统计之旅(2012)
  18. 宋,雷;潘玉婷;陈思红;张雪红:作为测序微生物基因组整合热点的GMP合成酶基因组岛结构特征(2012)
  19. 王秀英;洪珊琳:用调整(k)均值方法选择系统发生树(2012)
  20. 布拉泽维奇、雅克;福尔马诺维奇,皮奥特;凯兹奥拉,帕维尔;马西尼亚克,帕维尔;Taront,Przemyslaw:自适应记忆规划:系统进化树构建的局部搜索并行算法(2011)

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