FFBSKAT公司 swMATH ID: 23136 软件作者： Svishcheva GR，Belonogova NM，Axenovich TI 描述： FFBSKAT：快速基于家族的序列核关联测试。基于核机器的回归是一种有效的基于区域的关联分析方法，旨在识别罕见的遗传变异。然而，这种方法计算复杂。对于具有遗传（子）结构的样本，基于核的关联分析的运行时间变得特别长，因此需要开发新的有效方法、算法和软件包。我们开发了一种新的R包，称为快速家族序列核关联测试（FFBSKAT），用于分析相关个体样本中的数量性状。该软件实施了基于评分的方差成分测试，以评估给定的一组单核苷酸多态性与连续表型的关联。我们使用Genetic Analysis Workshop 17家族样本，将我们的软件与两个现有的基于家族的序列核关联测试软件（即ASKAT和famSKAT）的性能进行了比较。结果表明，FFBSKAT比其他可用程序快几倍。此外，三种比较软件的计算结果也同样准确。关于可用的分析模式，我们结合了ASKAT和famSKAT的优点，并添加了新的选项来增强FFBSKAT用户的能力。FFBSKAT软件包快速、用户友好，提供了一种易于使用的方法，可以对相关个体样本中的数量性状进行基于全核机器的回归关联分析。FFBSKAT包及其手册可从以下网站免费下载：http://mga.bionet.nsc.ru/soft/FFBSKAT/。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4048315网址/ 相关软件： GCTA公司;家谱;艾根斯特拉;家谱;lme4公司;fda（右）;PLINK公司;打开DMAP;NoFold公司;卡纳;记录仪;RNA集群;IgRepertoire构造函数;GraphClust（图形俱乐部）;RNA表面;Rnall公司;梅维;RNA链;格拉维斯托;墨卡托 引用于： 2文件 全部的 前5名18位作者引用 1 克里斯托弗·阿莫斯。 1 Bailey-Wilson，Joan E。 1 陈伟 1 Chiu、Chi-Yang 1 伊维特·康利（Yvette P.Conley）。 1 理查德·库克。 1 范汝宗 1 迈克尔·戈林。 1 蒋英达 1 乔纳森·基思（Jonathan M.Keith）。 1 M'Hamed Lajmi，Lakhal-Chaieb 1 Francis J.麦克马洪。 1 安娜·I·巴斯克斯。 1 周，Daniel E。 1 亚历山大·威尔逊。 1 熊、莫妙 1 袁、敖 1 钟晓刚 引用于2个系列 1 美国统计协会杂志 1 分子生物学方法 在3个字段中引用 1 总体主题；集合（00-XX） 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文