贝叶斯峰 swMATH ID: 18843 软件作者： 乔纳森·凯恩斯（Jonathan M.Cairns）。；克里斯蒂安娜·斯皮鲁；罗里·斯塔克；Mike L.Smith。；林奇，安迪·G。；西蒙·塔瓦雷 描述： BayesPeak-用于分析芯片级数据的R包。动机：识别ChIP-seq数据中感兴趣的基因组区域，通常称为峰调用，目的是找到转录因子结合位点、修饰组蛋白或核小体的位置。BayesPeak算法是为了使用贝叶斯统计技术对数据结构建模而开发的，它被证明是一种可靠的方法，但没有全基因组实现。结果：在本说明中，我们介绍了BayesPeak，一个用于全基因组峰值调用的R包，它提供了Bayes peak算法的灵活实现，并与下游BioConductor包兼容。BayesPeak包引入了一种总结后验概率输出的新方法，以及处理过拟合和支持并行处理的方法。我们将该软件包与其他常见的峰值调用程序进行了简要比较。可用性：作为BioConductor版本2.6的一部分提供。网址：http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/BayesPeak.html 主页： http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/BayesPeak.html 依赖项： R（右） 相关软件： H峰值;FindPeaks公司;DEG序列;边缘R;R（右）;ModHMM公司;深度工具2;铬HMM;github;计数;KEGG公司;星形底座;BSMAP公司;烤面包;天鹅绒;阿拉伯;拼接陷阱;DWE公司;CLIPZ公司;mir工具 引用于： 4文件 全部的 前5名14位作者引用 1 Alhaji，Baba B。 1 阿兰塞（Ana M.Aransay）。 1 菲利普·本纳 1 戴洪生 1 迈克尔·哈肯伯格 1 安德鲁·哈里森。 1 Yoshiko Hayashi 1 伯特霍尔德·劳森 1 萨维里奥·兰西娅 1 罗德里格斯-埃兹佩列塔，奈亚拉 1 维罗妮卡·文西奥蒂 1 马丁·文格伦 1 辛齐亚·维罗利 1 威特，恩斯特 2篇连载文章中引用 1 应用统计学杂志 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 在3个字段中引用 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 2 统计学（62-XX） 1 总体主题；集合（00-XX） 按年份列出的引文