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深度工具2

swMATH ID: 29059
软件作者: Ramírez,F.等人
描述: deepTools2:用于深度排序数据分析的下一代web服务器。我们对基于Galaxy的web服务器进行了更新,以处理和可视化深度排序的数据。其核心工具集deepTools允许用户执行完整的生物信息工作流,从质量控制和对齐读取的规范化到综合分析,包括聚类和可视化方法。自2014年首次描述deepTools Galaxy服务器以来,我们已经为社区和用户的许多请求实施了新的解决方案。在这里,我们引入了显著的增强功能和新工具,以进一步改进数据可视化和解释。deepTools继续向所有用户开放,并在deepTools.ie-freiburg.mpg.de上作为web服务免费提供。新的deepTools2套件可以通过工具库轻松部署在任何Galaxy框架中,我们还提供了在Linux和Mac OS X下使用命令行的源代码。还提供了用于访问deepTools功能的公共和文档化API。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4987876/
相关软件: ModHMM公司;铬HMM;github;贝叶斯峰
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