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iCDI-PseFpt公司

swMATH ID: 30067
软件作者: 肖宣;闵建良;王璞;周国晨
描述: iCDI PseFpt:通过PseAAC和分子指纹识别细胞网络中的通道-药物相互作用。生命中的许多重要功能,如心跳、感觉传导和中枢神经系统反应,都是由细胞通过各种离子通道发出的信号控制的。因此,离子通道已成为一种优良的药物靶点,研究离子通道-药物相互作用网络是药物开发的一个重要课题。然而,通过实验技术确定药物和蛋白质离子通道是否在细胞网络中相互作用既耗时又昂贵。尽管一些计算方法是基于蛋白质三维结构的知识在这方面发展起来的,但不幸的是,由于大多数蛋白质离子通道的三维结构仍然未知,它们的使用非常有限。随着后基因组时代产生的蛋白质序列雪崩,开发基于序列的计算方法来解决这个问题是非常必要的。为了应对这一挑战,我们开发了一种名为extbf{iCDI-PseFpt}的新预测器,其中蛋白质离子通道样品由灰色模型理论生成的PseAAC(伪氨基酸组成)配制,药物化合物由2D分子指纹配制,运算引擎为模糊(K)-最近邻算法。extbf{iCDI-PseFpt}通过折刀交叉验证获得的总成功率为87.27
主页: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022519313003871
关键词: 离子通道;灰色模型;分子指纹;模糊(K)-最近邻算法;伪氨基酸组成
相关软件: iRSpot-PseDNC公司;iEzy-药物;iSNO-PseAAC公司;国际RSpot-TNCPseAAC;iNuc-PhysChem;iNuc-PseKNC;iHSP-PseRAAAC系统;财产;iSNO-AAP航空公司;AA索引;PseAAC-建筑商;PseAAC公司;伦敦银行支持向量机;iLoc-Euk公司;iLoc-Hum公司;位置传感器;iLoc-Gpos公司;iLoc-Virus病毒;KEGG公司;iNR-PhysChem公司
引用于: 15文件

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