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iLoc-Virus病毒

swMATH ID: 22417
软件作者: Xiao,X。;吴振中。;周,K.-C。
描述: iLoc-Virus:一种多标记学习分类器,用于识别具有单个和多个位点的病毒蛋白的亚细胞定位。在过去二十年左右的时间里,虽然开发了许多计算方法来根据蛋白质的序列信息预测蛋白质的亚细胞位置,但这仍然是一个具有挑战性的问题,特别是当相关系统同时包含单长和多长蛋白质时。此外,在现有的方法中,很少有专门用于处理病毒产生的病毒蛋白的方法。实际上,了解病毒蛋白在宿主细胞或病毒感染细胞中的亚细胞定位非常重要,因为这与它们的破坏倾向和后果密切相关。本文通过引入“多标签尺度”,将基因本体信息与序列进化信息相结合,开发了一种称为iLoc-Virus的预测器。它可用于在以下六个位置鉴定病毒蛋白:(1)病毒衣壳,(2)宿主细胞膜,(3)宿主内质网,(4)宿主细胞质,(5)宿主细胞核,和(6)分泌。iLoc-Virus预测器不仅可以更准确地预测病毒蛋白在宿主细胞中的位置,而且具有处理具有多个位置的病毒蛋白的能力。作为一个用户友好的网络服务器,公众可以通过以下网址免费访问iLoc-Virus:http://icpr.jci.edu.cn/bioinfo/iLoc-Virus。同时,还提供了如何使用web服务器获得所需结果的分步指南。此外,为了方便用户,iLoc-Virus网络服务器还具有接受批量作业提交的功能。预计iLoc-Virus可能成为基础研究和药物开发的有用的高通量工具。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21684290
相关软件: iLoc-Euk公司;细胞PLoc;iLoc-Hum公司;iLoc-Gpos公司;iLoc-工厂;工厂-mPLoc;iLoc-动物;iRSpot-PseDNC公司;欧盟-mPLoc;机密P;伦敦银行支持向量机;综合布线;爆炸;PSI-爆炸;财产;NR-2L型;Gneg-mPLoc公司;GPCR-2L型;欧洲公共图书馆;PseAAC-建筑商
引用于: 31文件

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